Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

IGBP1C

IGBP1 family member C

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
17q22
Koordináták
17. kromoszóma: 58 660 424–58 692 045 (GRCh38)
Exonok
2 exon, összesen 31,6 kb
Fehérje
340 aminosav
Korábbi jelölések
IGBP1P2
MANE Select transzkriptum
ENST00000583666.3NM_001395966.1
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) IGBP1C gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A IGBP1C felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
17. kromoszóma, a IGBP1C helyét zárójel jelöli. A IGBP1C és környékén 17 gén a 17. kromoszómán, 58 176 235–59 176 234 között.17. kromoszóma17q22p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.358,2 Mb58,4 Mb58,6 Mb58,8 Mb59 MbEPX: 58 192 726–58 205 174, előre szálEPXMKS1: 58 205 350–58 219 605, fordított szálMKS1LPO: 58 218 548–58 268 518, előre szálLPOMPO: 58 269 855–58 280 935, fordított szálMPOTSPOAP1: 58 301 228–58 328 823, fordított szálTSPOAP1SUPT4H1: 58 345 175–58 353 099, fordított szálSUPT4H1: 58 345 206–58 417 595, fordított szálRNF43: 58 353 671–58 417 735, fordított szálRNF43HSF5: 58 420 167–58 488 408, fordított szálHSF5MTMR4: 58 489 529–58 517 905, fordított szálMTMR4SEPTIN4: 58 519 969–58 544 368, fordított szálSEPTIN4TEX14: 58 556 678–58 692 055, fordított szálTEX14IGBP1C: 58 660 424–58 692 045, fordított szálIGBP1CRAD51C: 58 692 569–58 735 611, előre szálRAD51CPPM1E: 58 755 851–58 985 179, előre szálPPM1ETRIM37: 58 982 633–59 106 921, fordított szálTRIM37SKA2: 59 109 857–59 155 260, fordított szálSKA2PRR11: 59 155 732–59 206 709, előre szálPRR11A IGBP1C ábrája: 2 exon a(z) 17. kromoszóma fordított szálán2. exon: 58 660 424–58 661 829, 1406 bázis1. exon: 58 691 939–58 692 045, 107 bázis215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 31,6 kb-jából 1,5 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1023 bázis kódolja a fehérjét.

IGBP1C szekvenálása

1Alacsony

Mennyire nehéz a IGBP1C szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

  • Leképezhetőség1,1%
  • Homológia0%
  • Ismétlődések0,8%
  • GC-tartalom5,3%
  • Referencia-lefedettség0%

1

a IGBP1C génben olyan pozíció, ahol a ClinVar a változást patogénnek vagy valószínűleg patogénnek minősíti

Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen találnak meg.

A teljes genom a IGBP1C gén mind a 31,6 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csupán az 1,5 kb-nyi exont.

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
  • Adatkiadás: 2026.10.17-8666dff2.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). IGBP1C gén: IGBP1 family member C. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/igbp1c

Vancouver

Dante Labs. IGBP1C gén: IGBP1 family member C [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/igbp1c

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet