Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

LPO

lactoperoxidase

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
17q22
Koordináták
17. kromoszóma: 58 238 584–58 268 518 (GRCh38)
Exonok
13 exon, összesen 29,9 kb
Fehérje
712 aminosav
Más néven ismert
SPO
MANE Select transzkriptum
ENST00000262290.9NM_006151.3
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) LPO gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A LPO felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
17. kromoszóma, a LPO helyét zárójel jelöli. A LPO és környékén 21 gén a 17. kromoszómán, 57 753 551–58 753 550 között.17. kromoszóma17q22p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.357,8 Mb58 Mb58,2 Mb58,4 Mb58,6 MbMRPS23: 57 834 781–57 850 076, fordított szálMRPS23CUEDC1: 57 861 231–57 955 851, fordított szálCUEDC1VEZF1: 57 971 547–57 988 389, fordított szálVEZF1: 57 989 038–58 007 246, fordított szálSRSF1: 57 996 889–58 007 346, fordított szálSRSF1DYNLL2: 58 082 825–58 095 542, előre szálDYNLL2OR4D1: 58 148 384–58 159 585, előre szálOR4D1OR4D2: 58 166 982–58 171 411, előre szálOR4D2EPX: 58 192 726–58 205 174, előre szálEPXMKS1: 58 205 350–58 219 605, fordított szálMKS1LPO: 58 238 584–58 268 518, előre szálLPOMPO: 58 269 855–58 280 935, fordított szálMPOTSPOAP1: 58 301 228–58 328 823, fordított szálTSPOAP1SUPT4H1: 58 345 175–58 353 099, fordított szálSUPT4H1: 58 345 206–58 417 595, fordított szálRNF43: 58 353 671–58 417 735, fordított szálRNF43HSF5: 58 420 167–58 488 408, fordított szálHSF5MTMR4: 58 489 529–58 517 905, fordított szálMTMR4SEPTIN4: 58 519 969–58 544 368, fordított szálSEPTIN4TEX14: 58 556 678–58 692 055, fordított szálTEX14IGBP1C: 58 660 424–58 692 055, fordított szálIGBP1CRAD51C: 58 692 569–58 735 611, előre szálRAD51CA LPO ábrája: 13 exon a(z) 17. kromoszóma előre szálán1. exon: 58 238 584–58 238 739, 156 bázis2. exon: 58 242 978–58 243 055, 78 bázis3. exon: 58 243 994–58 244 081, 88 bázis4. exon: 58 247 478–58 247 638, 161 bázis5. exon: 58 249 060–58 249 177, 118 bázis6. exon: 58 249 566–58 249 695, 130 bázis7. exon: 58 250 415–58 250 621, 207 bázis8. exon: 58 252 182–58 252 506, 325 bázis9. exon: 58 254 811–58 254 971, 161 bázis10. exon: 58 264 722–58 264 974, 253 bázis11. exon: 58 266 153–58 266 326, 174 bázis12. exon: 58 267 349–58 267 586, 238 bázis13. exon: 58 267 787–58 268 518, 732 bázis1510135′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 29,9 kb-jából 2,8 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2139 bázis kódolja a fehérjét.

LPO szekvenálása

1Könnyű

Mennyire nehéz a LPO rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A LPO exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a LPO exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések0%
  • GC-tartalom6,4%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

1

a LPO azon pozíciója, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti a változást

Ezek közül egy sem olyan régióban van, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.

A teljes genom a LPO mind a 29,9 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 2,8 kb exont.

ClinVar pathogenic variants (1)

The LPO variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.

  • Patogén/valószínűleg patogén 1
VariánsConditionsClinVar-besorolásFelülvizsgálati állapot
NM_000250.2(MPO):c.2031-2A>C (opens in a new tab)Alzheimer disease type 1 and 1 otherPatogén/valószínűleg patogén2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
  • Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). LPO gén: lactoperoxidase. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/lpo

Vancouver

Dante Labs. LPO gén: lactoperoxidase [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/lpo

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet