Gén
HGF
hepatocyte growth factor
- HGNC 4893↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000019991↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 3082↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 7q21.11
- Koordináták
- 7. kromoszóma: 81 699 010–81 770 047 (GRCh38)
- Exonok
- 18 exon, összesen 71 kb
- Fehérje
- 728 aminosav
- Más néven ismert
- SF, F-TCF, HGFB, HPTA
- Korábbi jelölések
- DFNB39
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000222390.11NM_000601.6
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/hgf.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a HGF-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Hearing Loss and Deafness
- Nonsyndromic Genetic Hearing Loss
A 97 hozzá kapcsolódó gén egyike
Inherited hearing loss without other medical features, including the common recessive forms caused by GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC and many other genes, as well as dominant, X-linked and mitochondrial forms.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: mérsékelt
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Knowing the genetic cause can guide hearing support and cochlear implant decisions, gene-therapy trial eligibility (for example OTOF) and family counselling.
A HGF felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 71 kb-jából 5,8 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2187 bázis kódolja a fehérjét.
HGF szekvenálása
2Alacsony
Mennyire nehéz a HGF szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-bólMinden oszlop azt mutatja, hogy HGF exonjainak bázisai közül mekkora rész esik az adott típusú nehezen vizsgálható régióba. A pontszám ezeket az egyes régiók rövid olvasatú vizsgálatra gyakorolt hatása szerint súlyozza: 0, ha egyetlen bázis sem esik egyikbe sem, 100, ha minden bázis mindegyikbe beletartozik.
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így ott a hívás hiányozhat vagy hibás lehet. Súly: 35%.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Súly: 30%.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket esetleg nem fednek le. Súly: 15%.5,4%
- GC-tartalom25%-nál kevesebb vagy 65%-nál több G és C bázist tartalmazó ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Súly: 10%.9,5%
- Referencia-lefedettségHiányosságok a közeli referenciaszekvenciában, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez a rövid olvasatokat illeszteni lehetne. Súly: 10%.0%
1
a HGF génben olyan pozíció, ahol a ClinVar a változást patogénnek vagy valószínűleg patogénnek minősíti
Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen találnak meg.
A teljes genom a HGF gén mind a 71 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csupán az 5,8 kb-nyi exont.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ACTG1actin gamma 11 betegséget oszt meg
- AFG2BAAA ATPase AFG2B1 betegséget oszt meg
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 11 betegséget oszt meg
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11A1 betegséget oszt meg
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 21 betegséget oszt meg
- CABP2calcium binding protein 21 betegséget oszt meg
- CD164CD164 molecule1 betegséget oszt meg
- CDC14Acell division cycle 14A1 betegséget oszt meg
- CDH23cadherin related 231 betegséget oszt meg
- CEACAM16CEA cell adhesion molecule 16, tectorial membrane component1 betegséget oszt meg
- CIB2calcium and integrin binding family member 21 betegséget oszt meg
- CLDN14claudin 141 betegséget oszt meg
A(z) HGF génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) HGF gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-17 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.17-8666dff2.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). HGF gén: hepatocyte growth factor. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/hgf
Dante Labs. HGF gén: hepatocyte growth factor [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/hgf
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt