Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

FXR2

FMR1 autosomal homolog 2

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
17p13.1
Koordináták
17. kromoszóma: 7 591 230–7 614 897 (GRCh38)
Exonok
17 exon, összesen 23,7 kb
Fehérje
673 aminosav
Korábbi jelölések
FMR1L2
MANE Select transzkriptum
ENST00000250113.12NM_004860.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) FXR2 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A FXR2 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
17. kromoszóma, a FXR2 helyét zárójel jelöli. A FXR2 és környékén 66 gén a 17. kromoszómán, 7 103 064–8 103 063 között.17. kromoszóma17p13.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.37,2 Mb7,4 Mb7,6 Mb7,8 Mb8 MbASGR2: 7 100 166–7 116 603, fordított szálASGR2ASGR1: 7 172 427–7 179 666, fordított szálASGR1DLG4: 7 187 187–7 219 836, fordított szálDLG4ACADVL: 7 217 125–7 225 273, előre szálDVL2: 7 225 338–7 234 538, fordított szálPHF23: 7 235 029–7 239 722, fordított szálGABARAP: 7 240 008–7 242 486, fordított szál: 7 240 427–7 244 635, fordított szálCTDNEP1: 7 243 583–7 252 841, fordított szál: 7 246 829–7 262 089, fordított szálELP5: 7 250 818–7 260 165, előre szálELP5CLDN7: 7 257 359–7 264 016, fordított szálCLDN7SLC2A4: 7 281 664–7 289 241, előre szálYBX2: 7 288 253–7 294 750, fordított szálYBX2EIF5A: 7 306 944–7 312 506, előre szálGPS2: 7 309 470–7 315 564, fordított szál: 7 312 661–7 319 174, fordított szálNEURL4: 7 315 628–7 329 393, fordított szálNEURL4ACAP1: 7 332 960–7 351 478, előre szálKCTD11: 7 351 889–7 354 944, előre szálKCTD11TMEM95: 7 355 123–7 357 219, előre szálTMEM95TNK1: 7 380 534–7 389 779, előre szálTNK1PLSCR3: 7 389 727–7 397 054, fordított szálPLSCR3TMEM256-PLSCR3: 7 389 734–7 404 097, fordított szálTMEM256: 7 402 774–7 404 138, fordított szálNLGN2: 7 404 684–7 419 860, előre szálSPEM1: 7 420 323–7 421 637, előre szálSPEM2: 7 425 563–7 427 568, előre szálSPEM3: 7 428 857–7 432 820, előre szál: 7 428 861–7 436 278, előre szálTMEM102: 7 435 344–7 437 679, előre szálFGF11: 7 438 128–7 444 937, előre szálFGF11CHRNB1: 7 445 004–7 457 710, előre szálCHRNB1ZBTB4: 7 459 366–7 484 278, fordított szálZBTB4SLC35G6: 7 481 446–7 483 496, előre szálSLC35G6POLR2A: 7 484 366–7 514 616, előre szálPOLR2ATNFSF12: 7 548 508–7 557 890, előre szálTNFSF12-TNFSF13: 7 549 099–7 561 601, előre szálTNFSF13: 7 558 251–7 561 660, előre szálSENP3: 7 561 867–7 571 969, előre szálSENP3-EIF4A1: 7 563 287–7 578 715, előre szálEIF4A1: 7 572 718–7 579 007, előre szálCD68: 7 579 380–7 582 515, előre szálMPDU1: 7 583 214–7 594 419, előre szálMPDU1SOX15: 7 588 178–7 590 101, fordított szálSOX15FXR2: 7 591 230–7 614 897, fordított szálFXR2SHBG: 7 613 946–7 633 469, előre szálSHBGSAT2: 7 626 234–7 627 879, fordított szálATP1B2: 7 646 627–7 657 771, előre szálATP1B2TP53: 7 661 779–7 687 546, fordított szálTP53WRAP53: 7 686 071–7 703 505, előre szálWRAP53EFNB3: 7 705 172–7 711 372, előre szálEFNB3DNAH2: 7 717 728–7 833 742, előre szálDNAH2KDM6B: 7 834 193–7 854 808, előre szálKDM6BTMEM88: 7 855 057–7 856 114, előre szálTMEM88NAA38: 7 856 681–7 885 238, fordított szálNAA38CYB5D1: 7 857 696–7 862 282, előre szálCYB5D1CHD3: 7 884 787–7 912 760, előre szálCHD3RNF227: 7 913 238–7 916 377, fordított szálKCNAB3: 7 920 956–7 929 856, fordított szálKCNAB3: 7 925 931–7 930 622, fordított szálTRAPPC1: 7 930 345–7 932 123, fordított szálTRAPPC1CNTROB: 7 932 101–7 949 953, előre szálGUCY2D: 8 002 615–8 020 342, előre szálGUCY2DALOX15B: 8 039 011–8 049 134, előre szálALOX15BALOX12B: 8 068 594–8 087 716, fordított szálALOX12BALOXE3: 8 095 900–8 119 047, fordított szálALOXE3A FXR2 ábrája: 17 exon a(z) 17. kromoszóma fordított szálán17. exon: 7 591 230–7 591 925, 696 bázis16. exon: 7 592 254–7 592 354, 101 bázis15. exon: 7 592 504–7 592 599, 96 bázis14. exon: 7 592 694–7 592 894, 201 bázis13. exon: 7 592 984–7 593 181, 198 bázis12. exon: 7 593 403–7 593 625, 223 bázis11. exon: 7 593 918–7 594 004, 87 bázis10. exon: 7 594 238–7 594 347, 110 bázis9. exon: 7 594 679–7 594 757, 79 bázis8. exon: 7 595 824–7 595 994, 171 bázis7. exon: 7 601 409–7 601 525, 117 bázis6. exon: 7 602 909–7 603 002, 94 bázis5. exon: 7 603 757–7 603 905, 149 bázis4. exon: 7 604 009–7 604 080, 72 bázis3. exon: 7 605 645–7 605 738, 94 bázis2. exon: 7 606 097–7 606 149, 53 bázis1. exon: 7 614 452–7 614 897, 446 bázis171510515′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 23,7 kb-jából 3 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2022 bázis kódolja a fehérjét.

FXR2 szekvenálása

4Könnyű

Mennyire nehéz a FXR2 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-as skálán

A FXR2 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen található, ahol a rövid olvasatok tisztán illeszthetők.

Ehhez hozzájárul: a FXR2 exonjainak aránya az egyes nehéz régiótípusokban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Ismétlődések12%
  • GC-tartalom21%
  • Referencia-lefedettség0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle nehezen szekvenálható régiókat bemutató térképeire épül.Hogyan számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). FXR2 gén: FMR1 autosomal homolog 2. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/fxr2

Vancouver

Dante Labs. FXR2 gén: FMR1 autosomal homolog 2 [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/fxr2

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet