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Gene

ZSWIM9

zinc finger SWIM-type containing 9

Sintesi

Localizzazione citogenetica
19q13.33
Coordinate
Cromosoma 19: 48.170.680–48.197.620 (GRCh38)
Esoni
4 esoni su 26,9 kb
Proteina
920 amminoacidi
Noto anche come
LOC374920
Simboli precedenti
C19orf68
Trascritto MANE Select
ENST00000614654.2NM_199341.4
Tipo di locus
Codificanti per proteine
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora ZSWIM9. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di ZSWIM9

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 19, con una parentesi dove si trova ZSWIM9. ZSWIM9 e 34 geni nelle vicinanze sul cromosoma 19, da 47.684.150 a 48.684.149.Cromosoma 1919q13.33p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4347,8 Mb48 Mb48,2 Mb48,4 Mb48,6 MbBICRA: 47.608.196–47.703.277, filamento direttoBICRAEHD2: 47.713.388–47.745.089, filamento direttoEHD2NOP53: 47.745.481–47.758.208, filamento direttoNOP53SELENOW: 47.778.508–47.784.686, filamento direttoSELENOWTPRX1: 47.801.232–47.819.051, filamento inversoTPRX1CRX: 47.819.779–47.843.330, filamento direttoCRXTPRX2: 47.859.235–47.861.721, filamento direttoTPRX2SULT2A1: 47.870.327–47.886.479, filamento inversoSULT2A1BSPH1: 47.968.046–47.992.170, filamento inversoBSPH1ELSPBP1: 47.994.632–48.025.154, filamento direttoELSPBP1CABP5: 48.029.383–48.044.079, filamento inversoCABP5PLA2G4C: 48.047.843–48.111.390, filamento inversoPLA2G4CLIG1: 48.115.444–48.170.654, filamento inversoLIG1ZSWIM9: 48.170.680–48.197.620, filamento direttoZSWIM9CARD8: 48.180.770–48.255.976, filamento inversoCARD8ZNF114: 48.270.041–48.289.292, filamento direttoZNF114ODAD1: 48.296.355–48.321.971, filamento inversoODAD1EMP3: 48.321.310–48.330.560, filamento direttoEMP3TMEM143: 48.329.918–48.364.245, filamento inversoTMEM143SYNGR4: 48.364.260–48.376.377, filamento direttoSYNGR4KDELR1: 48.382.558–48.393.837, filamento inversoKDELR1GRIN2D: 48.393.668–48.444.931, filamento direttoGRIN2DGRWD1: 48.445.512–48.458.382, filamento direttoGRWD1KCNJ14: 48.454.464–48.466.980, filamento direttoKCNJ14: 48.465.837–48.472.431, filamento direttoCYTH2: 48.469.203–48.482.314, filamento direttoCYTH2LMTK3: 48.485.271–48.513.935, filamento inversoSULT2B1: 48.552.140–48.599.425, filamento direttoSULT2B1SACK1E: 48.599.961–48.615.093, filamento inversoSACK1ESPACA4: 48.606.742–48.607.962, filamento direttoSPACA4RPL18: 48.615.284–48.619.213, filamento inversoRPL18SPHK2: 48.619.291–48.630.717, filamento direttoDBP: 48.630.030–48.637.695, filamento inversoCA11: 48.637.946–48.646.386, filamento inversoNTN5: 48.661.407–48.673.081, filamento inversoNTN5Diagramma di ZSWIM9: 4 esoni sul filamento diretto del cromosoma 19Esone 1: 48.170.680–48.170.714, 35 basiEsone 2: 48.171.794–48.172.077, 284 basiEsone 3: 48.182.455–48.182.767, 313 basiEsone 4: 48.194.653–48.197.620, 2968 basi12345′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 3,6 kb dei 26,9 kb del gene; 2763 di queste basi codificano la proteina.

Sequenziamento di ZSWIM9

10Facile

Quanto è difficile sequenziare ZSWIM9 con letture corte, su 100

Quasi tutti gli esoni di ZSWIM9 si trovano in regioni in cui le letture corte si allineano in modo chiaro.

A ciò si aggiunge: la quota di esoni di ZSWIM9 in ciascun tipo di regione difficile

  • Mappabilità0%
  • Omologia0%
  • Shared with chrY0%
  • Copertura del riferimento0%
  • Ripetizioni0,6%
  • Contenuto GC49%

Un punteggio di Dante Labs basato su nostre ricerche, costruito sulle mappe delle regioni difficili da sequenziare di NIST Genome in a Bottle.Come viene calcolato

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, gli altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • Le stratificazioni del genoma Genome in a Bottle, da NIST: il punteggio di difficoltà di sequenziamento.

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Dante Labs. (s.d.). Gene ZSWIM9: zinc finger SWIM-type containing 9. Consultato il 19 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/zswim9

Vancouver

Dante Labs. Gene ZSWIM9: zinc finger SWIM-type containing 9 [Internet]. [citato il 19 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/zswim9

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