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Gène

VPS28

VPS28 subunit of ESCRT-I

Résumé

Localisation cytogénétique
8q24.3
Coordonnées
Chromosome 8 : 144 423 617–144 428 548 (GRCh38)
Exons
10 exons sur 4,9 kb
Protéine
221 acides aminés
Aussi appelé
CIIA
Transcrit MANE Select
ENST00000292510.6NM_016208.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore VPS28. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de VPS28

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 8, avec un crochet à l'emplacement de VPS28. VPS28 et 47 gènes à proximité sur le chromosome 8, de 143 926 083 à 144 926 082.Chromosome 88q24.3p23.3p23.2p23.1p22p21.3p21.2p21.1p12p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.3144 Mb144,2 Mb144,4 Mb144,6 Mb144,8 MbPLEC : 143 915 152–143 977 039, brin inversePLECPARP10 : 143 977 151–144 019 930, brin inversePARP10GRINA : 143 990 048–143 994 935, brin directGRINASPATC1 : 144 012 275–144 047 114, brin directSPATC1OPLAH : 144 051 265–144 064 091, brin inverseEXOSC4 : 144 078 560–144 081 408, brin direct : 144 078 642–144 084 330, brin directGPAA1 : 144 082 337–144 093 149, brin directCYC1 : 144 095 039–144 097 525, brin directSHARPIN : 144 097 513–144 108 124, brin inverseSHARPINMAF1 : 144 103 112–144 107 618, brin directMAF1WDR97 : 144 107 726–144 118 328, brin directWDR97HGH1 : 144 137 774–144 140 851, brin directHGH1MROH1 : 144 147 975–144 262 470, brin directMROH1BOP1 : 144 262 045–144 291 453, brin inverseBOP1SCX : 144 266 446–144 268 481, brin directSCXHSF1 : 144 291 521–144 314 729, brin directHSF1DGAT1 : 144 314 584–144 326 916, brin inverseDGAT1SCRT1 : 144 330 565–144 336 503, brin inverseSLC52A2 : 144 333 957–144 361 447, brin directCATSPERQ : 144 352 219–144 354 954, brin inverse : 144 353 228–144 355 609, brin inverseFBXL6 : 144 355 427–144 359 376, brin inverseFBXL6ADCK5 : 144 373 101–144 393 243, brin directADCK5CPSF1 : 144 393 229–144 409 864, brin inverseCPSF1SLC39A4 : 144 409 742–144 416 894, brin inverseSLC39A4VPS28 : 144 423 617–144 428 548, brin inverseVPS28TONSL : 144 428 763–144 444 488, brin inverseTONSLZFTRAF1 : 144 447 345–144 462 908, brin inverseTMEM276-ZFTRAF1 : 144 449 582–144 465 430, brin inverseTMEM276 : 144 463 817–144 466 890, brin inverseTMEM276KIFC2 : 144 465 940–144 474 202, brin directFOXH1 : 144 473 412–144 475 873, brin inversePPP1R16A : 144 475 989–144 502 126, brin directGPT : 144 502 608–144 507 494, brin directGPTSLC33A2 : 144 508 263–144 511 317, brin directSLC33A2RECQL4 : 144 511 284–144 517 890, brin inverseLRRC14 : 144 517 957–144 526 244, brin directLRRC24 : 144 522 385–144 527 608, brin inverseC8orf82 : 144 525 733–144 529 132, brin inverseARHGAP39 : 144 529 179–144 685 879, brin inverseZNF251 : 144 720 515–144 756 417, brin inverseZNF251ZNF34 : 144 770 441–144 788 684, brin inverseZNF34RPL8 : 144 789 765–144 793 502, brin inverseRPL8ZNF517 : 144 798 863–144 813 034, brin directZNF517ZNF7 : 144 826 894–144 848 546, brin directZNF7COMMD5 : 144 837 760–144 854 229, brin inverseCOMMD5ZNF250 : 144 876 497–144 902 217, brin inverseZNF250Schéma de VPS28 : 10 exons sur le brin inverse du chromosome 8Exon 10 : 144 423 617–144 423 922, 306 basesExon 9 : 144 424 041–144 424 132, 92 basesExon 8 : 144 424 215–144 424 268, 54 basesExon 7 : 144 424 718–144 424 819, 102 basesExon 6 : 144 424 946–144 425 051, 106 basesExon 5 : 144 425 683–144 425 772, 90 basesExon 4 : 144 426 026–144 426 063, 38 basesExon 3 : 144 426 180–144 426 208, 29 basesExon 2 : 144 426 909–144 426 979, 71 basesExon 1 : 144 428 489–144 428 548, 60 bases109876543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 0,9 kb sur les 4,9 kb du gène ; 666 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène VPS28 : VPS28 subunit of ESCRT-I. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/vps28

Vancouver

Dante Labs. Gène VPS28 : VPS28 subunit of ESCRT-I [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/vps28

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