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Gène

SMCR8

SMCR8-C9orf72 complex subunit

Résumé

Localisation cytogénétique
17p11.2
Coordonnées
Chromosome 17 : 18 315 293–18 328 056 (GRCh38)
Exons
2 exons sur 12,8 kb
Protéine
937 acides aminés
Aussi appelé
FLJ34716, DENND8A
Transcrit MANE Select
ENST00000406438.5NM_144775.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SMCR8. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SMCR8

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 17, avec un crochet à l'emplacement de SMCR8. SMCR8 et 19 gènes à proximité sur le chromosome 17, de 17 821 675 à 18 821 674.Chromosome 1717p11.2p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.318 Mb18,2 Mb18,4 Mb18,6 Mb18,8 MbSREBF1 : 17 810 399–17 837 035, brin inverseSREBF1TOM1L2 : 17 843 507–17 972 470, brin inverseTOM1L2DRC3 : 17 972 813–18 016 889, brin directDRC3ATPAF2 : 17 977 409–18 040 833, brin inverseATPAF2GID4 : 18 039 371–18 068 405, brin directGID4DRG2 : 18 087 876–18 107 979, brin directDRG2MYO15A : 18 108 756–18 179 802, brin directMYO15AALKBH5 : 18 183 034–18 209 954, brin directALKBH5LLGL1 : 18 225 542–18 244 876, brin directLLGL1FLII : 18 244 782–18 260 420, brin inverseFLIIMIEF2 : 18 259 527–18 266 552, brin directMIEF2TOP3A : 18 271 428–18 315 025, brin inverseTOP3ASMCR8 : 18 315 293–18 328 056, brin directSMCR8SHMT1 : 18 327 686–18 363 562, brin inverseSHMT1EVPLL : 18 377 674–18 389 652, brin directEVPLLLGALS9C : 18 476 737–18 494 945, brin directLGALS9CTBC1D28 : 18 634 247–18 644 427, brin inverseTBC1D28FOXO3B : 18 667 629–18 682 314, brin inverseFOXO3BFBXW10 : 18 744 026–18 779 349, brin directFBXW10TVP23B : 18 781 111–18 806 772, brin directTVP23BSchéma de SMCR8 : 2 exons sur le brin direct du chromosome 17Exon 1 : 18 315 293–18 318 149, 2 857 basesExon 2 : 18 322 617–18 328 056, 5 440 bases125′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 8,3 kb sur les 12,8 kb du gène ; 2 814 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SMCR8 : SMCR8-C9orf72 complex subunit. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/smcr8

Vancouver

Dante Labs. Gène SMCR8 : SMCR8-C9orf72 complex subunit [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/smcr8

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