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Gène

LLGL1

LLGL scribble cell polarity complex component 1

Résumé

Localisation cytogénétique
17p11.2
Coordonnées
Chromosome 17 : 18 225 635–18 244 875 (GRCh38)
Exons
23 exons sur 19,2 kb
Protéine
1 064 acides aminés
Aussi appelé
Lgl1, Mgl1
Symboles précédents
DLG4, LLGL, HUGL, HUGL-1
Transcrit MANE Select
ENST00000316843.9NM_004140.4
Type de locus
gene with protein product

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

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Structure de LLGL1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 17, avec un crochet à l'emplacement de LLGL1. LLGL1 et 18 gènes à proximité sur le chromosome 17, de 17 735 255 à 18 735 254.Chromosome 1717p11.2p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.317,8 Mb18 Mb18,2 Mb18,4 Mb18,6 MbRAI1 : 17 681 323–17 811 453, brin directRAI1SREBF1 : 17 810 399–17 837 035, brin inverseSREBF1TOM1L2 : 17 843 507–17 972 470, brin inverseTOM1L2DRC3 : 17 972 813–18 016 889, brin directDRC3ATPAF2 : 17 977 409–18 040 833, brin inverseATPAF2GID4 : 18 039 371–18 068 405, brin directGID4DRG2 : 18 087 876–18 107 979, brin directDRG2MYO15A : 18 108 756–18 179 802, brin directMYO15AALKBH5 : 18 183 034–18 209 954, brin directALKBH5LLGL1 : 18 225 635–18 244 875, brin directLLGL1FLII : 18 244 782–18 260 420, brin inverseFLIIMIEF2 : 18 259 527–18 266 552, brin directMIEF2TOP3A : 18 271 428–18 315 025, brin inverseTOP3ASMCR8 : 18 315 293–18 328 056, brin directSMCR8SHMT1 : 18 327 686–18 363 562, brin inverseSHMT1EVPLL : 18 377 674–18 389 652, brin directEVPLLLGALS9C : 18 476 737–18 494 945, brin directLGALS9CTBC1D28 : 18 634 247–18 644 427, brin inverseTBC1D28FOXO3B : 18 667 629–18 682 314, brin inverseFOXO3BSchéma de LLGL1 : 23 exons sur le brin direct du chromosome 17Exon 1 : 18 225 635–18 225 763, 129 basesExon 2 : 18 229 941–18 230 038, 98 basesExon 3 : 18 232 495–18 232 576, 82 basesExon 4 : 18 232 672–18 232 802, 131 basesExon 5 : 18 233 778–18 233 936, 159 basesExon 6 : 18 234 013–18 234 175, 163 basesExon 7 : 18 234 273–18 234 408, 136 basesExon 8 : 18 234 649–18 234 703, 55 basesExon 9 : 18 234 839–18 234 993, 155 basesExon 10 : 18 235 089–18 235 312, 224 basesExon 11 : 18 235 470–18 235 537, 68 basesExon 12 : 18 236 607–18 236 760, 154 basesExon 13 : 18 236 835–18 236 939, 105 basesExon 14 : 18 237 481–18 237 773, 293 basesExon 15 : 18 238 067–18 238 214, 148 basesExon 16 : 18 238 456–18 238 609, 154 basesExon 17 : 18 240 578–18 240 873, 296 basesExon 18 : 18 241 451–18 241 715, 265 basesExon 19 : 18 241 885–18 241 999, 115 basesExon 20 : 18 242 166–18 242 278, 113 basesExon 21 : 18 242 508–18 242 628, 121 basesExon 22 : 18 242 743–18 242 822, 80 basesExon 23 : 18 243 908–18 244 875, 968 bases1246810121416182022235′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,2 kb sur les 19,2 kb du gène ; 3 195 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène LLGL1 : LLGL scribble cell polarity complex component 1. Consulté le 16 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/llgl1

Vancouver

Dante Labs. Gène LLGL1 : LLGL scribble cell polarity complex component 1 [Internet]. [consulté le 16 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/llgl1

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