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Gène

SLC38A12

solute carrier family 38 member 12

Résumé

Localisation cytogénétique
17q25.1
Coordonnées
Chromosome 17 : 74 776 499–74 839 753 (GRCh38)
Exons
10 exons sur 63,3 kb
Protéine
496 acides aminés
Aussi appelé
FLJ20255, FLJ00021
Symboles précédents
TMEM104
Transcrit MANE Select
ENST00000335464.10NM_017728.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SLC38A12. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SLC38A12

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 17, avec un crochet à l'emplacement de SLC38A12. SLC38A12 et 36 gènes à proximité sur le chromosome 17, de 74 308 126 à 75 308 125.Chromosome 1717q25.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.374,4 Mb74,6 Mb74,8 Mb75 Mb75,2 MbDNAI2 : 74 274 230–74 314 886, brin directDNAI2KIF19 : 74 326 188–74 355 835, brin directKIF19BTBD17 : 74 355 751–74 361 908, brin inverseBTBD17GPR142 : 74 367 458–74 372 600, brin directGPR142GPRC5C : 74 424 851–74 459 120, brin directGPRC5CCD300A : 74 466 387–74 506 382, brin directCD300ACD300LB : 74 519 000–74 531 487, brin inverseCD300LBCD300C : 74 534 362–74 546 174, brin inverseCD300CCD300H : 74 560 701–74 567 343, brin inverseCD300HCD300LD : 74 579 365–74 592 283, brin inverseCD300LDCD300E : 74 609 878–74 623 857, brin inverseCD300ERAB37 : 74 670 578–74 747 337, brin directRAB37CD300LF : 74 694 308–74 713 002, brin inverseCD300LFNHERF1 : 74 748 607–74 769 360, brin directNHERF1NAT9 : 74 769 697–74 776 384, brin inverseNAT9SLC38A12 : 74 776 499–74 839 753, brin directSLC38A12GRIN2C : 74 842 022–74 861 772, brin inverseGRIN2CFDXR : 74 862 494–74 873 039, brin inverseFDXRFADS6 : 74 877 281–74 893 781, brin inverseFADS6USH1G : 74 916 083–74 923 256, brin inverseUSH1GOTOP2 : 74 922 950–74 933 912, brin directOTOP2OTOP3 : 74 935 829–74 949 993, brin directOTOP3HID1 : 74 950 739–74 973 166, brin inverseHID1CDR2L : 74 987 580–75 005 800, brin directCDR2LMRPL58 : 75 012 657–75 021 266, brin directMRPL58KCTD2 : 75 032 575–75 065 889, brin directKCTD2ATP5PD : 75 038 618–75 047 718, brin inverseATP5PDSLC16A5 : 75 077 226–75 107 420, brin directSLC16A5ARMC7 : 75 109 941–75 130 272, brin directARMC7NT5C : 75 130 225–75 131 806, brin inverseNT5CJPT1 : 75 135 243–75 168 281, brin inverseJPT1SUMO2 : 75 165 586–75 182 991, brin inverseSUMO2NUP85 : 75 205 482–75 235 759, brin directNUP85GGA3 : 75 236 595–75 262 363, brin inverseGGA3MRPS7 : 75 261 662–75 270 708, brin directMRPS7MIF4GD : 75 266 228–75 271 237, brin inverseMIF4GDSLC25A19 : 75 272 012–75 289 968, brin inverseSchéma de SLC38A12 : 10 exons sur le brin direct du chromosome 17Exon 1 : 74 776 499–74 776 577, 79 basesExon 2 : 74 777 264–74 777 375, 112 basesExon 3 : 74 785 482–74 785 603, 122 basesExon 4 : 74 788 789–74 788 870, 82 basesExon 5 : 74 790 200–74 790 296, 97 basesExon 6 : 74 790 956–74 791 036, 81 basesExon 7 : 74 795 012–74 795 111, 100 basesExon 8 : 74 795 524–74 795 632, 109 basesExon 9 : 74 819 750–74 819 843, 94 basesExon 10 : 74 835 927–74 839 753, 3 827 bases15105′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,7 kb sur les 63,3 kb du gène ; 1 491 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SLC38A12 : solute carrier family 38 member 12. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/slc38a12

Vancouver

Dante Labs. Gène SLC38A12 : solute carrier family 38 member 12 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/slc38a12

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