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Gène

ATP5PD

ATP synthase peripheral stalk subunit d

Résumé

Localisation cytogénétique
17q25.1
Coordonnées
Chromosome 17 : 75 038 863–75 046 969 (GRCh38)
Exons
6 exons sur 8,1 kb
Protéine
161 acides aminés
Aussi appelé
ATPQ, ATP5JD
Symboles précédents
ATP5H
Transcrit MANE Select
ENST00000301587.9NM_006356.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

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Structure de ATP5PD

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 17, avec un crochet à l'emplacement de ATP5PD. ATP5PD et 34 gènes à proximité sur le chromosome 17, de 74 542 916 à 75 542 915.Chromosome 1717q25.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.374,6 Mb74,8 Mb75 Mb75,2 Mb75,4 MbCD300C : 74 534 362–74 546 174, brin inverseCD300CCD300H : 74 560 701–74 567 343, brin inverseCD300HCD300LD : 74 579 365–74 592 283, brin inverseCD300LDCD300E : 74 609 878–74 623 857, brin inverseCD300ERAB37 : 74 670 578–74 747 337, brin directRAB37CD300LF : 74 694 308–74 713 002, brin inverseCD300LFNHERF1 : 74 748 607–74 769 360, brin directNHERF1NAT9 : 74 769 697–74 776 384, brin inverseNAT9SLC38A12 : 74 776 477–74 839 764, brin directSLC38A12GRIN2C : 74 842 022–74 861 772, brin inverseGRIN2CFDXR : 74 862 494–74 873 039, brin inverseFDXRFADS6 : 74 877 281–74 893 781, brin inverseFADS6USH1G : 74 916 083–74 923 256, brin inverseUSH1GOTOP2 : 74 922 950–74 933 912, brin directOTOP2OTOP3 : 74 935 829–74 949 993, brin directOTOP3HID1 : 74 950 739–74 973 166, brin inverseHID1CDR2L : 74 987 580–75 005 800, brin directCDR2LMRPL58 : 75 012 657–75 021 266, brin directMRPL58KCTD2 : 75 032 575–75 065 889, brin directKCTD2ATP5PD : 75 038 863–75 046 969, brin inverseATP5PDSLC16A5 : 75 077 226–75 107 420, brin directSLC16A5ARMC7 : 75 109 941–75 130 272, brin directARMC7NT5C : 75 130 225–75 131 806, brin inverseNT5CJPT1 : 75 135 243–75 168 281, brin inverseJPT1SUMO2 : 75 165 586–75 182 991, brin inverseSUMO2NUP85 : 75 205 482–75 235 759, brin directNUP85GGA3 : 75 236 595–75 262 363, brin inverseGGA3MRPS7 : 75 261 662–75 270 708, brin directMRPS7MIF4GD : 75 266 228–75 271 237, brin inverseMIF4GDSLC25A19 : 75 272 012–75 289 968, brin inverseGRB2 : 75 318 072–75 405 720, brin inverseGRB2TMEM94 : 75 441 159–75 500 452, brin directTMEM94CASKIN2 : 75 500 261–75 515 621, brin inverseCASKIN2TSEN54 : 75 515 944–75 524 748, brin directTSEN54LLGL2 : 75 525 080–75 575 215, brin directLLGL2Schéma de ATP5PD : 6 exons sur le brin inverse du chromosome 17Exon 6 : 75 038 863–75 039 063, 201 basesExon 5 : 75 039 209–75 039 271, 63 basesExon 4 : 75 040 092–75 040 163, 72 basesExon 3 : 75 042 181–75 042 277, 97 basesExon 2 : 75 042 529–75 042 659, 131 basesExon 1 : 75 046 925–75 046 969, 45 bases6543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 0,6 kb sur les 8,1 kb du gène ; 486 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène ATP5PD : ATP synthase peripheral stalk subunit d. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/atp5pd

Vancouver

Dante Labs. Gène ATP5PD : ATP synthase peripheral stalk subunit d [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/atp5pd

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