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Gène

TOP1

DNA topoisomerase I

Résumé

Localisation cytogénétique
20q12
Coordonnées
Chromosome 20 : 41 028 822–41 124 487 (GRCh38)
Exons
21 exons sur 95,7 kb
Protéine
765 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000361337.3NM_003286.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore TOP1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de TOP1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 20, avec un crochet à l'emplacement de TOP1. TOP1 et 6 gènes à proximité sur le chromosome 20, de 40 576 655 à 41 576 654.Chromosome 2020q12p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3340,6 Mb40,8 Mb41 Mb41,2 Mb41,4 MbMAFB : 40 685 848–40 689 236, brin inverseMAFBTOP1 : 41 028 822–41 124 487, brin directTOP1PLCG1 : 41 136 931–41 196 801, brin directPLCG1ZHX3 : 41 178 448–41 317 783, brin inverseZHX3LPIN3 : 41 340 786–41 360 583, brin directLPIN3EMILIN3 : 41 359 962–41 366 855, brin inverseEMILIN3CHD6 : 41 402 083–41 618 555, brin inverseCHD6Schéma de TOP1 : 21 exons sur le brin direct du chromosome 20Exon 1 : 41 028 822–41 029 100, 279 basesExon 2 : 41 029 431–41 029 455, 25 basesExon 3 : 41 061 394–41 061 490, 97 basesExon 4 : 41 076 171–41 076 294, 124 basesExon 5 : 41 077 582–41 077 637, 56 basesExon 6 : 41 080 085–41 080 180, 96 basesExon 7 : 41 081 165–41 081 240, 76 basesExon 8 : 41 084 462–41 084 568, 107 basesExon 9 : 41 092 472–41 092 587, 116 basesExon 10 : 41 097 220–41 097 341, 122 basesExon 11 : 41 098 215–41 098 337, 123 basesExon 12 : 41 100 056–41 100 243, 188 basesExon 13 : 41 101 209–41 101 353, 145 basesExon 14 : 41 112 782–41 112 925, 144 basesExon 15 : 41 113 970–41 114 155, 186 basesExon 16 : 41 115 371–41 115 439, 69 basesExon 17 : 41 116 278–41 116 392, 115 basesExon 18 : 41 118 169–41 118 296, 128 basesExon 19 : 41 121 696–41 121 790, 95 basesExon 20 : 41 122 006–41 122 155, 150 basesExon 21 : 41 123 195–41 124 487, 1 293 bases1215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,7 kb sur les 95,7 kb du gène ; 2 298 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène TOP1 : DNA topoisomerase I. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/top1

Vancouver

Dante Labs. Gène TOP1 : DNA topoisomerase I [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/top1

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