Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

ZC3H7B

zinc finger CCCH-type containing 7B

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
22q13.2
Koordinaatit
Kromosomi 22: 41 301 525–41 360 147 (GRCh38)
Eksonit
23 eksonia 58,6 kb:n alueella
Proteiini
977 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
RoXaN, FLJ13787, DKFZp434K0920, KIAA1031
MANE Select -transkripti
ENST00000352645.5NM_017590.6
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä ZC3H7B. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

ZC3H7B-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 22, jossa hakasulke osoittaa ZC3H7B-geenin sijainnin. ZC3H7B ja 20 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 22, välillä 40 830 836–41 830 835.Kromosomi 2222q13.2p13p12p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.31q13.32q13.3341 Mb41,2 Mb41,4 Mb41,6 Mb41,8 MbST13: 40 824 445–40 856 919, juoste taaksepäinST13XPNPEP3: 40 857 054–40 932 815, juoste eteenpäinXPNPEP3DNAJB7: 40 859 549–40 862 113, juoste taaksepäinDNAJB7RBX1: 40 951 277–40 973 539, juoste eteenpäinRBX1EP300: 41 091 816–41 180 077, juoste eteenpäinEP300L3MBTL2: 41 205 282–41 231 623, juoste eteenpäinL3MBTL2CHADL: 41 229 256–41 241 000, juoste taaksepäinCHADLRANGAP1: 41 243 474–41 302 744, juoste taaksepäinRANGAP1ZC3H7B: 41 301 525–41 360 147, juoste eteenpäinZC3H7BTEF: 41 367 333–41 399 326, juoste eteenpäinTEFTOB2: 41 433 489–41 447 602, juoste taaksepäinTOB2ACO2: 41 447 830–41 529 273, juoste eteenpäinACO2PHF5A: 41 448 895–41 468 713, juoste taaksepäinPHF5APOLR3H: 41 525 799–41 544 606, juoste taaksepäinPOLR3HCSDC2: 41 560 758–41 577 741, juoste eteenpäinCSDC2PMM1: 41 576 886–41 595 275, juoste taaksepäinPMM1DESI1: 41 598 028–41 621 089, juoste taaksepäinDESI1XRCC6: 41 620 786–41 664 087, juoste eteenpäinXRCC6SNU13: 41 666 627–41 690 504, juoste taaksepäinSNU13MEI1: 41 699 494–41 799 456, juoste eteenpäinMEI1CCDC134: 41 800 321–41 832 178, juoste eteenpäinCCDC134ZC3H7B-kaavio: 23 eksonia kromosomin 22 juosteella, eteenpäinEkson 1: 41 301 525–41 301 772, 248 emästäEkson 2: 41 320 655–41 320 713, 59 emästäEkson 3: 41 325 564–41 325 597, 34 emästäEkson 4: 41 325 721–41 325 918, 198 emästäEkson 5: 41 327 206–41 327 364, 159 emästäEkson 6: 41 330 023–41 330 103, 81 emästäEkson 7: 41 332 171–41 332 227, 57 emästäEkson 8: 41 338 313–41 338 355, 43 emästäEkson 9: 41 339 001–41 339 191, 191 emästäEkson 10: 41 339 816–41 340 137, 322 emästäEkson 11: 41 341 088–41 341 146, 59 emästäEkson 12: 41 342 529–41 342 628, 100 emästäEkson 13: 41 343 415–41 343 576, 162 emästäEkson 14: 41 346 003–41 346 208, 206 emästäEkson 15: 41 348 067–41 348 167, 101 emästäEkson 16: 41 349 120–41 349 301, 182 emästäEkson 17: 41 351 561–41 351 646, 86 emästäEkson 18: 41 355 469–41 355 602, 134 emästäEkson 19: 41 355 757–41 355 862, 106 emästäEkson 20: 41 355 954–41 356 062, 109 emästäEkson 21: 41 356 343–41 356 476, 134 emästäEkson 22: 41 356 645–41 356 808, 164 emästäEkson 23: 41 357 177–41 360 147, 2 971 emästä15101520235′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 5,9 kb geenin 58,6 kb:stä; 2 934 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

ZC3H7B-geenin sekvensointi

10Helppo

Kuinka vaikea ZC3H7B-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki ZC3H7B-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joihin lyhyet lukemat kohdistuvat selvästi.

Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa ZC3H7B-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Yhteinen chrY:n kanssa0 %
  • Referenssin kattavuus0 %
  • Toistot3,3 %
  • GC-pitoisuus45 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). ZC3H7B-geeni: zinc finger CCCH-type containing 7B. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/zc3h7b

Vancouver

Dante Labs. ZC3H7B-geeni: zinc finger CCCH-type containing 7B [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/zc3h7b

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test