Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

ZC3H3

zinc finger CCCH-type containing 3

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
8q24.3
Koordinaatit
Kromosomi 8: 143 437 659–143 541 447 (GRCh38)
Eksonit
12 eksonia 103,8 kb:n alueella
Proteiini
948 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
KIAA0150
Aiemmat symbolit
ZC3HDC3
MANE Select -transkripti
ENST00000262577.6NM_015117.3
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä ZC3H3. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

ZC3H3-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 8, jossa hakasulke osoittaa ZC3H3-geenin sijainnin. ZC3H3 ja 31 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 8, välillä 142 989 553–143 989 552.Kromosomi 88q24.3p23.3p23.2p23.1p22p21.3p21.2p21.1p12p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.3143 Mb143,2 Mb143,4 Mb143,6 Mb143,8 MbLY6E: 143 012 722–143 023 835, juoste eteenpäinLY6ELY6S: 143 040 839–143 048 357, juoste taaksepäinLY6SLY6L: 143 080 299–143 083 486, juoste eteenpäinLY6LLY6H: 143 157 914–143 160 711, juoste taaksepäinLY6HGPIHBP1: 143 213 019–143 217 172, juoste eteenpäinGPIHBP1ZFP41: 143 245 996–143 262 705, juoste eteenpäinZFP41: 143 247 110–143 276 403, juoste eteenpäinGLI4: 143 263 193–143 276 937, juoste eteenpäinGLI4ZNF696: 143 289 676–143 299 952, juoste eteenpäinZNF696TOP1MT: 143 301 453–143 359 979, juoste taaksepäinTOP1MTRHPN1: 143 368 810–143 384 221, juoste eteenpäinRHPN1MAFA: 143 419 182–143 430 732, juoste taaksepäinMAFAZC3H3: 143 437 659–143 541 447, juoste taaksepäinZC3H3GSDMD: 143 553 207–143 563 062, juoste eteenpäinGSDMDMROH6: 143 566 188–143 573 110, juoste taaksepäinMROH6NAPRT: 143 574 782–143 578 649, juoste taaksepäinNAPRTEEF1D: 143 579 697–143 599 541, juoste taaksepäinEEF1DTIGD5: 143 597 831–143 603 224, juoste eteenpäinPYCR3: 143 603 210–143 609 773, juoste taaksepäinGFUS: 143 612 617–143 618 048, juoste taaksepäinZNF623: 143 635 518–143 656 418, juoste eteenpäinZNF623ZNF707: 143 684 452–143 713 898, juoste eteenpäinZNF707CCDC166: 143 706 694–143 708 109, juoste taaksepäinCCDC166MAPK15: 143 716 279–143 722 458, juoste eteenpäinMAPK15SACK1H: 143 723 933–143 740 732, juoste taaksepäinSACK1HIQANK1: 143 733 510–143 790 645, juoste eteenpäinSCRIB: 143 790 920–143 815 792, juoste taaksepäinSCRIBPUF60: 143 816 344–143 830 709, juoste taaksepäinPUF60NRBP2: 143 833 583–143 841 109, juoste taaksepäinNRBP2EPPK1: 143 857 324–143 878 468, juoste taaksepäinEPPK1PLEC: 143 915 152–143 977 039, juoste taaksepäinPLECPARP10: 143 977 151–144 019 930, juoste taaksepäinPARP10ZC3H3-kaavio: 12 eksonia kromosomin 8 juosteella, taaksepäinEkson 12: 143 437 659–143 438 087, 429 emästäEkson 11: 143 440 041–143 440 363, 323 emästäEkson 10: 143 440 936–143 441 120, 185 emästäEkson 9: 143 465 717–143 465 848, 132 emästäEkson 8: 143 468 209–143 468 278, 70 emästäEkson 7: 143 468 382–143 468 540, 159 emästäEkson 6: 143 468 617–143 468 659, 43 emästäEkson 5: 143 475 398–143 475 585, 188 emästäEkson 4: 143 507 746–143 507 899, 154 emästäEkson 3: 143 536 257–143 536 453, 197 emästäEkson 2: 143 538 003–143 539 320, 1 318 emästäEkson 1: 143 541 376–143 541 447, 72 emästä1210515′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 3,3 kb geenin 103,8 kb:stä; 2 847 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

ZC3H3-geenin sekvensointi

14Helppo

Kuinka vaikea ZC3H3-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki ZC3H3-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joihin lyhyet lukemat kohdistuvat selvästi.

Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa ZC3H3-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Yhteinen chrY:n kanssa0 %
  • Referenssin kattavuus0 %
  • Toistot5,1 %
  • GC-pitoisuus64 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). ZC3H3-geeni: zinc finger CCCH-type containing 3. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/zc3h3

Vancouver

Dante Labs. ZC3H3-geeni: zinc finger CCCH-type containing 3 [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/zc3h3

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test