Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

STPG3

sperm-tail PG-rich repeat containing 3

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
9q34.3
Koordinaatit
Kromosomi 9: 137 251 286–137 253 483 (GRCh38)
Eksonit
6 eksonia 2,2 kb:n alueella
Proteiini
308 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
FLJ40246
Aiemmat symbolit
C9orf173
MANE Select -transkripti
ENST00000412566.6NM_001004353.4
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä STPG3. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

STPG3-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
Kromosomi 9, jossa hakasulke osoittaa STPG3-geenin sijainnin. STPG3 ja 57 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 9, välillä 136 752 385–137 752 384.Kromosomi 99q34.3p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.3136,8 Mb137 Mb137,2 Mb137,4 Mb137,6 MbLCN8: 136 754 386–136 758 543, juoste taaksepäinLCN8LCN15: 136 759 634–136 766 255, juoste taaksepäinLCN15TMEM141: 136 791 303–136 793 317, juoste eteenpäin: 136 791 379–136 800 595, juoste eteenpäinCCDC183: 136 796 338–136 807 741, juoste eteenpäinRABL6: 136 807 848–136 841 187, juoste eteenpäinAJM1: 136 842 478–136 848 801, juoste eteenpäinAJM1PHPT1: 136 847 994–136 851 043, juoste eteenpäinPHPT1MAMDC4: 136 850 943–136 860 802, juoste eteenpäinMAMDC4EDF1: 136 862 113–136 866 343, juoste taaksepäinEDF1TRAF2: 136 881 903–136 929 221, juoste eteenpäinTRAF2FBXW5: 136 938 431–136 950 122, juoste taaksepäinC8G: 136 942 532–136 946 980, juoste eteenpäinC8GLCN12: 136 949 391–136 956 535, juoste eteenpäinPTGDS: 136 975 053–136 981 750, juoste eteenpäin: 136 977 518–136 985 435, juoste eteenpäinLCNL1: 136 981 904–136 986 410, juoste eteenpäinLCNL1PAXX: 136 992 400–136 994 074, juoste eteenpäinPAXXCLIC3: 136 994 608–136 996 729, juoste taaksepäinCLIC3ABCA2: 137 007 226–137 028 915, juoste taaksepäinFUT7: 137 030 174–137 032 825, juoste taaksepäin: 137 031 241–137 040 436, juoste taaksepäinNPDC1: 137 037 577–137 046 700, juoste taaksepäinENTPD2: 137 048 107–137 054 069, juoste taaksepäinENTPD2SAPCD2: 137 062 127–137 070 593, juoste taaksepäinSAPCD2UAP1L1: 137 077 470–137 084 544, juoste eteenpäinUAP1L1MAN1B1: 137 085 917–137 109 189, juoste eteenpäinMAN1B1DPP7: 137 110 540–137 118 309, juoste taaksepäinDPP7GRIN1: 137 138 346–137 168 765, juoste eteenpäinLRRC26: 137 168 758–137 170 058, juoste taaksepäinLRRC26: 137 168 854–137 171 984, juoste taaksepäinTMEM210: 137 170 858–137 172 056, juoste taaksepäinTMEM210ANAPC2: 137 174 784–137 189 028, juoste taaksepäinSSNA1: 137 188 640–137 190 371, juoste eteenpäinTPRN: 137 191 617–137 204 193, juoste taaksepäinTMEM203: 137 204 082–137 205 648, juoste taaksepäinNDOR1: 137 205 662–137 219 371, juoste eteenpäinRNF229: 137 217 494–137 219 361, juoste eteenpäinRNF208: 137 219 577–137 222 312, juoste taaksepäinCYSRT1: 137 225 174–137 226 315, juoste eteenpäinRNF224: 137 226 908–137 229 640, juoste eteenpäinSLC34A3: 137 230 757–137 236 555, juoste eteenpäinTUBB4B: 137 241 278–137 243 713, juoste eteenpäinTUBB4BCIMIP2A: 137 243 584–137 247 770, juoste taaksepäinCIMIP2ASTPG3: 137 251 286–137 253 483, juoste eteenpäinSTPG3NELFB: 137 255 210–137 273 542, juoste eteenpäinNELFBTOR4A: 137 274 854–137 282 641, juoste eteenpäinNRARP: 137 299 631–137 302 271, juoste taaksepäinNRARPEXD3: 137 306 894–137 423 911, juoste taaksepäinEXD3NOXA1: 137 422 752–137 434 451, juoste eteenpäinNOXA1ENTPD8: 137 434 362–137 441 881, juoste taaksepäinENTPD8NSMF: 137 447 570–137 459 576, juoste taaksepäinNSMFPNPLA7: 137 459 952–137 550 560, juoste taaksepäinPNPLA7MRPL41: 137 550 424–137 552 555, juoste eteenpäinMRPL41DPH7: 137 554 436–137 578 936, juoste taaksepäinDPH7ZMYND19: 137 582 066–137 590 520, juoste taaksepäinZMYND19ARRDC1: 137 605 619–137 617 859, juoste eteenpäinARRDC1EHMT1: 137 618 901–137 870 016, juoste eteenpäinEHMT1STPG3-kaavio: 6 eksonia kromosomin 9 juosteella, eteenpäinEkson 1: 137 251 286–137 251 396, 111 emästäEkson 2: 137 251 738–137 251 895, 158 emästäEkson 3: 137 252 001–137 252 135, 135 emästäEkson 4: 137 252 437–137 252 525, 89 emästäEkson 5: 137 252 662–137 252 965, 304 emästäEkson 6: 137 253 115–137 253 483, 369 emästä1234565′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 1,2 kb geenin 2,2 kb:stä; 927 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Sekvensointi: STPG3

9Helppo

Kuinka vaikea STPG3 on sekvensoida lyhyin lukemin, asteikolla 0–100

Lähes kaikki geenin STPG3 eksonit sijaitsevat alueilla, joilla lyhyet lukemat kartoittuvat selvästi.

Lisäksi vaikuttaa: geenin STPG3 eksonien osuus kussakin vaikeassa alueluokassa

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Toistot0 %
  • GC-pitoisuus86 %
  • Referenssikattavuus0 %

Dante Labsin oman tutkimukseen perustuva pistemäärä, joka pohjautuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pistemäärä lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). STPG3-geeni: sperm-tail PG-rich repeat containing 3. Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/stpg3

Vancouver

Dante Labs. STPG3-geeni: sperm-tail PG-rich repeat containing 3 [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/stpg3

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test