Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

SHTN1

shootin 1

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
10q25.3
Koordinaatit
Kromosomi 10: 116 881 477–117 005 187 (GRCh38)
Eksonit
17 eksonia 123,7 kb:n alueella
Proteiini
631 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
shootin1, shootin-1
Aiemmat symbolit
KIAA1598
MANE Select -transkripti
ENST00000355371.9NM_001127211.3
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä SHTN1. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

SHTN1-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 10, jossa hakasulke osoittaa SHTN1-geenin sijainnin. SHTN1 ja 11 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 10, välillä 116 443 332–117 443 331.Kromosomi 1010q25.3p15.3p15.2p15.1p14p13p12.33p12.32p12.31p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.31q23.32q23.33q24.1q24.2q24.31q24.32q24.33q25.1q25.2q25.3q26.11q26.12q26.13q26.2q26.3116,6 Mb116,8 Mb117 Mb117,2 Mb117,4 MbPNLIPRP3: 116 427 847–116 477 964, juoste eteenpäinPNLIPRP3PNLIP: 116 545 931–116 567 855, juoste eteenpäinPNLIPPNLIPRP1: 116 590 385–116 609 175, juoste eteenpäinPNLIPRP1PNLIPRP2: 116 620 953–116 645 143, juoste eteenpäinPNLIPRP2SPMIP5: 116 662 208–116 670 312, juoste taaksepäinSPMIP5HSPA12A: 116 671 192–116 850 251, juoste taaksepäinHSPA12AENO4: 116 849 481–116 911 788, juoste eteenpäinENO4SHTN1: 116 881 477–117 005 187, juoste taaksepäinSHTN1VAX1: 117 128 521–117 138 629, juoste taaksepäinVAX1KCNK18: 117 196 957–117 210 752, juoste eteenpäinKCNK18SLC18A2: 117 240 830–117 279 431, juoste eteenpäinSLC18A2PDZD8: 117 277 274–117 376 020, juoste taaksepäinPDZD8SHTN1-kaavio: 17 eksonia kromosomin 10 juosteella, taaksepäinEkson 17: 116 881 477–116 886 566, 5 090 emästäEkson 16: 116 901 765–116 901 957, 193 emästäEkson 15: 116 906 627–116 906 747, 121 emästäEkson 14: 116 911 790–116 911 843, 54 emästäEkson 13: 116 915 375–116 915 484, 110 emästäEkson 12: 116 921 434–116 921 516, 83 emästäEkson 11: 116 927 792–116 927 891, 100 emästäEkson 10: 116 929 849–116 930 002, 154 emästäEkson 9: 116 940 466–116 940 612, 147 emästäEkson 8: 116 944 924–116 945 018, 95 emästäEkson 7: 116 948 916–116 948 997, 82 emästäEkson 6: 116 951 909–116 952 006, 98 emästäEkson 5: 116 954 042–116 954 210, 169 emästäEkson 4: 116 960 136–116 960 230, 95 emästäEkson 3: 116 968 652–116 968 712, 61 emästäEkson 2: 116 979 256–116 979 308, 53 emästäEkson 1: 117 005 022–117 005 187, 166 emästä1716141210864215′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 6,9 kb geenin 123,7 kb:stä; 1 896 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

SHTN1-geenin sekvensointi

3Helppo

Kuinka vaikea SHTN1-geeni on sekvensoida lyhyillä luennoilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki SHTN1-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joissa lyhyet luennat kohdistuvat selvästi.

Lisäksi vaikuttaa se, kuinka suuri osa SHTN1-geenin eksoneista sijaitsee kussakin vaikeassa alueessa.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Shared with chrY0 %
  • Referenssin peittävyys0 %
  • Toistot6,8 %
  • GC-pitoisuus2,6 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). SHTN1-geeni: shootin 1. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/shtn1

Vancouver

Dante Labs. SHTN1-geeni: shootin 1 [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/shtn1

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test