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Gene

SHTN1

shootin 1

Resumo

Localização citogenética
10q25.3
Coordenadas
Cromossoma 10: 116 881 477–117 005 187 (GRCh38)
Exões
17 exões ao longo de 123,7 kb
Proteína
631 aminoácidos
Também conhecido como
shootin1, shootin-1
Símbolos anteriores
KIAA1598
Transcrito MANE Select
ENST00000355371.9NM_001127211.3
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa SHTN1 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como SHTN1 está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 10, com um parêntese onde se situa SHTN1. SHTN1 e 11 genes próximos no cromossoma 10, de 116 443 332 a 117 443 331.Cromossoma 1010q25.3p15.3p15.2p15.1p14p13p12.33p12.32p12.31p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.31q23.32q23.33q24.1q24.2q24.31q24.32q24.33q25.1q25.2q25.3q26.11q26.12q26.13q26.2q26.3116,6 Mb116,8 Mb117 Mb117,2 Mb117,4 MbPNLIPRP3: 116 427 847–116 477 964, fita diretaPNLIPRP3PNLIP: 116 545 931–116 567 855, fita diretaPNLIPPNLIPRP1: 116 590 385–116 609 175, fita diretaPNLIPRP1PNLIPRP2: 116 620 953–116 645 143, fita diretaPNLIPRP2SPMIP5: 116 662 208–116 670 312, fita inversaSPMIP5HSPA12A: 116 671 192–116 850 251, fita inversaHSPA12AENO4: 116 849 481–116 911 788, fita diretaENO4SHTN1: 116 881 477–117 005 187, fita inversaSHTN1VAX1: 117 128 521–117 138 629, fita inversaVAX1KCNK18: 117 196 957–117 210 752, fita diretaKCNK18SLC18A2: 117 240 830–117 279 431, fita diretaSLC18A2PDZD8: 117 277 274–117 376 020, fita inversaPDZD8Diagrama de SHTN1: 17 exões na cadeia inversa do cromossoma 10Exão 17: 116 881 477–116 886 566, 5090 basesExão 16: 116 901 765–116 901 957, 193 basesExão 15: 116 906 627–116 906 747, 121 basesExão 14: 116 911 790–116 911 843, 54 basesExão 13: 116 915 375–116 915 484, 110 basesExão 12: 116 921 434–116 921 516, 83 basesExão 11: 116 927 792–116 927 891, 100 basesExão 10: 116 929 849–116 930 002, 154 basesExão 9: 116 940 466–116 940 612, 147 basesExão 8: 116 944 924–116 945 018, 95 basesExão 7: 116 948 916–116 948 997, 82 basesExão 6: 116 951 909–116 952 006, 98 basesExão 5: 116 954 042–116 954 210, 169 basesExão 4: 116 960 136–116 960 230, 95 basesExão 3: 116 968 652–116 968 712, 61 basesExão 2: 116 979 256–116 979 308, 53 basesExão 1: 117 005 022–117 005 187, 166 bases1716141210864215′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 6,9 kb dos 123,7 kb do gene; 1896 dessas bases codificam a proteína.

Sequenciação de SHTN1

1Baixo

Grau de dificuldade de sequenciar SHTN1 com leituras curtas, em 100

  • Mapeabilidade0%
  • Homologia0%
  • Repetições6,8%
  • Teor de GC2,6%
  • Cobertura de referência0%

Ligações externas

De onde vem isto

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.

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Dante Labs. (s.d.). Gene SHTN1: shootin 1. Consultado em 17 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/shtn1

Vancouver

Dante Labs. Gene SHTN1: shootin 1 [Internet]. [consultado em 17 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/shtn1

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