Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

SH3BGRL3

SH3 domain binding glutamate rich protein like 3

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
1p36.11
Koordinaatit
Kromosomi 1: 26 280 086–26 281 522 (GRCh38)
Eksonit
3 eksonia 1,4 kb:n alueella
Proteiini
93 aminohappoa
MANE Select -transkripti
ENST00000270792.10NM_031286.4
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä SH3BGRL3. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

SH3BGRL3-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
Kromosomi 1, jossa hakasulke osoittaa SH3BGRL3-geenin sijainnin. SH3BGRL3 ja 28 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 1, välillä 25 780 804–26 780 803.Kromosomi 11p36.11p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4425,8 Mb26 Mb26,2 Mb26,4 Mb26,6 MbMAN1C1: 25 616 788–25 786 206, juoste eteenpäinMAN1C1SELENON: 25 800 180–25 818 221, juoste eteenpäinSELENON: 25 811 470–25 823 744, juoste eteenpäinMTFR1L: 25 818 640–25 835 879, juoste eteenpäinMTFR1LAUNIP: 25 831 913–25 859 463, juoste taaksepäinAUNIPPAQR7: 25 861 211–25 875 968, juoste taaksepäinPAQR7STMN1: 25 884 181–25 908 470, juoste taaksepäinSTMN1PAFAH2: 25 959 767–25 999 206, juoste taaksepäinPAFAH2EXTL1: 26 019 884–26 036 464, juoste eteenpäinEXTL1SLC30A2: 26 037 252–26 046 174, juoste taaksepäinSLC30A2TRIM63: 26 051 301–26 068 436, juoste taaksepäinTRIM63PDIK1L: 26 111 141–26 125 906, juoste eteenpäinPDIK1LFAM110D: 26 159 033–26 163 962, juoste eteenpäinC1orf232: 26 164 101–26 168 963, juoste taaksepäinZNF593OS: 26 169 516–26 171 832, juoste taaksepäinZNF593OSZNF593: 26 169 892–26 170 873, juoste eteenpäinZNF593CNKSR1: 26 177 459–26 189 886, juoste eteenpäinCNKSR1CATSPER4: 26 190 561–26 202 968, juoste eteenpäinCATSPER4CEP85: 26 233 669–26 278 814, juoste eteenpäinCEP85SH3BGRL3: 26 280 086–26 281 522, juoste eteenpäinSH3BGRL3UBXN11: 26 281 328–26 318 363, juoste taaksepäinUBXN11CD52: 26 317 907–26 320 527, juoste eteenpäinCD52CRYBG2: 26 321 698–26 360 080, juoste taaksepäinCRYBG2ZNF683: 26 361 634–26 374 522, juoste taaksepäinZNF683LIN28A: 26 410 788–26 429 728, juoste eteenpäinLIN28ADHDDS: 26 432 273–26 471 322, juoste eteenpäinDHDDSHMGN2: 26 471 495–26 487 537, juoste eteenpäinHMGN2RPS6KA1: 26 529 746–26 575 032, juoste eteenpäinRPS6KA1ARID1A: 26 693 236–26 782 104, juoste eteenpäinARID1ASH3BGRL3-kaavio: 3 eksonia kromosomin 1 juosteella, eteenpäinEkson 1: 26 280 086–26 280 203, 118 emästäEkson 2: 26 280 765–26 280 932, 168 emästäEkson 3: 26 281 058–26 281 522, 465 emästä1235′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 0,8 kb geenin 1,4 kb:stä; 282 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

SH3BGRL3-geenin sekvensointi

3Helppo

Kuinka vaikea SH3BGRL3-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki SH3BGRL3-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joihin lyhyet lukemat kohdistuvat selvästi.

Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa SH3BGRL3-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Yhteinen chrY:n kanssa0 %
  • Referenssin kattavuus0 %
  • Toistot0 %
  • GC-pitoisuus16 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). SH3BGRL3-geeni: SH3 domain binding glutamate rich protein like 3. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/sh3bgrl3

Vancouver

Dante Labs. SH3BGRL3-geeni: SH3 domain binding glutamate rich protein like 3 [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/sh3bgrl3

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test