Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

KIR2DL1

killer cell immunoglobulin like receptor, two Ig domains and long cytoplasmic tail 1

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
19q13.42
Koordinaatit
Kromosomi 19: 54 769 793–54 784 322 (GRCh38)
Eksonit
8 eksonia 14,5 kb:n alueella
Proteiini
348 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
cl-42, nkat1, 47.11, p58.1, CD158A
MANE Select -transkripti
ENST00000336077.11NM_014218.3
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä KIR2DL1. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

KIR2DL1-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 19, jossa hakasulke osoittaa KIR2DL1-geenin sijainnin. KIR2DL1 ja 36 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 19, välillä 54 277 058–55 277 057.Kromosomi 1919q13.42p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4354,4 Mb54,6 Mb54,8 Mb55 Mb55,2 MbLILRB2: 54 273 812–54 281 184, juoste taaksepäinLILRB2LILRA5: 54 307 037–54 313 177, juoste taaksepäinLILRA5LILRA4: 54 333 185–54 339 162, juoste taaksepäinLILRA4LAIR1: 54 351 384–54 370 558, juoste taaksepäinLAIR1TTYH1: 54 415 219–54 436 904, juoste eteenpäinTTYH1LENG8: 54 449 157–54 462 022, juoste eteenpäinLENG8LENG9: 54 461 732–54 463 778, juoste taaksepäinLENG9CDC42EP5: 54 465 026–54 473 316, juoste taaksepäinCDC42EP5LAIR2: 54 497 879–54 510 694, juoste eteenpäinLAIR2LILRA2: 54 572 920–54 590 287, juoste eteenpäinLILRA2LILRA1: 54 593 582–54 603 259, juoste eteenpäinLILRA1LILRB1: 54 616 309–54 638 022, juoste eteenpäinLILRB1LILRB4: 54 643 889–54 670 531, juoste eteenpäinLILRB4KIR3DL3: 54 724 442–54 736 632, juoste eteenpäinKIR3DL3KIR2DL3: 54 738 505–54 753 061, juoste eteenpäinKIR2DL3KIR2DL1: 54 769 793–54 784 322, juoste eteenpäinKIR2DL1KIR2DL4: 54 803 610–54 814 517, juoste eteenpäinKIR2DL4KIR3DL1: 54 816 440–54 830 778, juoste eteenpäinKIR3DL1KIR2DS4: 54 832 676–54 848 569, juoste eteenpäinKIR2DS4KIR3DL2: 54 850 433–54 867 209, juoste eteenpäinKIR3DL2FCAR: 54 874 227–54 891 420, juoste eteenpäinFCARNCR1: 54 906 112–54 941 199, juoste eteenpäinNCR1NLRP7: 54 923 454–54 966 312, juoste taaksepäinNLRP7NLRP2: 54 953 130–55 001 142, juoste eteenpäinNLRP2GP6: 55 012 055–55 038 264, juoste taaksepäinGP6RDH13: 55 039 108–55 071 291, juoste taaksepäinRDH13EPS8L1: 55 072 020–55 090 124, juoste eteenpäinEPS8L1PPP1R12C: 55 090 913–55 117 679, juoste taaksepäinPPP1R12CTNNT1: 55 131 662–55 149 351, juoste taaksepäinTNNT1TNNI3: 55 151 763–55 157 774, juoste taaksepäinTNNI3: 55 154 757–55 160 671, juoste taaksepäinDNAAF3: 55 158 661–55 166 722, juoste taaksepäinDNAAF3SYT5: 55 171 196–55 180 328, juoste taaksepäinPTPRH: 55 181 230–55 209 512, juoste taaksepäinPTPRHTMEM86B: 55 226 524–55 228 784, juoste taaksepäinTMEM86BPPP6R1: 55 229 776–55 259 070, juoste taaksepäinPPP6R1HSPBP1: 55 262 219–55 280 930, juoste taaksepäinHSPBP1KIR2DL1-kaavio: 8 eksonia kromosomin 19 juosteella, eteenpäinEkson 1: 54 769 793–54 769 884, 92 emästäEkson 2: 54 770 849–54 770 884, 36 emästäEkson 3: 54 773 333–54 773 632, 300 emästäEkson 4: 54 775 165–54 775 458, 294 emästäEkson 5: 54 778 612–54 778 662, 51 emästäEkson 6: 54 782 922–54 783 023, 102 emästäEkson 7: 54 783 486–54 783 538, 53 emästäEkson 8: 54 783 637–54 784 322, 686 emästä123456785′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 1,6 kb geenin 14,5 kb:stä; 1 047 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

KIR2DL1-geenin sekvensointi

77Vaikea

Kuinka vaikea KIR2DL1-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

Suuri osa KIR2DL1-geenistä sijaitsee kohdissa, joissa lyhyet lukemat voivat jättää muutoksen huomaamatta tai sijoittaa sen väärin.

Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa KIR2DL1-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.

  • Kartoitettavuus43 %
  • Homologia100 %
  • Yhteinen chrY:n kanssa0 %
  • Referenssin kattavuus0 %
  • Toistot3,5 %
  • GC-pitoisuus0 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). KIR2DL1-geeni: killer cell immunoglobulin like receptor, two Ig domains and long cytoplasmic tail 1. Haettu 20. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/kir2dl1

Vancouver

Dante Labs. KIR2DL1-geeni: killer cell immunoglobulin like receptor, two Ig domains and long cytoplasmic tail 1 [Internet]. [viitattu 20. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/kir2dl1

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test