Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

LAIR1

leukocyte associated immunoglobulin like receptor 1

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
19q13.42
Koordinaatit
Kromosomi 19: 54 351 384–54 364 931 (GRCh38)
Eksonit
10 eksonia 13,5 kb:n alueella
Proteiini
287 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
CD305, LAIR-1
MANE Select -transkripti
ENST00000391742.7NM_002287.6
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä LAIR1. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

LAIR1-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 19, jossa hakasulke osoittaa LAIR1-geenin sijainnin. LAIR1 ja 39 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 19, välillä 53 858 158–54 858 157.Kromosomi 1919q13.42p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4354 Mb54,2 Mb54,4 Mb54,6 Mb54,8 MbMYADM: 53 864 763–53 878 125, juoste eteenpäinMYADMPRKCG: 53 879 190–53 907 652, juoste eteenpäinPRKCGCACNG7: 53 909 264–53 943 950, juoste eteenpäinCACNG7CACNG8: 53 962 937–53 990 215, juoste eteenpäinCACNG8CACNG6: 53 991 605–54 012 670, juoste eteenpäinCACNG6VSTM1: 54 040 825–54 063 959, juoste taaksepäinVSTM1TARM1: 54 069 895–54 081 365, juoste taaksepäinOSCAR: 54 094 668–54 102 692, juoste taaksepäinOSCARNDUFA3: 54 102 728–54 111 522, juoste eteenpäinTFPT: 54 107 015–54 115 666, juoste taaksepäinTFPTPRPF31: 54 115 410–54 131 719, juoste eteenpäinPRPF31CNOT3: 54 137 710–54 155 708, juoste eteenpäinLENG1: 54 155 161–54 159 760, juoste taaksepäinLENG1TMC4: 54 160 095–54 173 250, juoste taaksepäinTMC4MBOAT7: 54 173 412–54 189 882, juoste taaksepäinTSEN34: 54 188 464–54 194 538, juoste eteenpäinTSEN34RPS9: 54 200 466–54 249 003, juoste eteenpäinRPS9LILRB3: 54 215 940–54 223 506, juoste taaksepäinLILRA6: 54 236 590–54 242 820, juoste taaksepäinLILRA6LILRB5: 54 249 421–54 257 339, juoste taaksepäinLILRB5LILRB2: 54 273 812–54 281 184, juoste taaksepäinLILRB2LILRA5: 54 307 037–54 313 177, juoste taaksepäinLILRA5LILRA4: 54 333 185–54 339 162, juoste taaksepäinLILRA4LAIR1: 54 351 384–54 364 931, juoste taaksepäinLAIR1TTYH1: 54 415 219–54 436 904, juoste eteenpäinTTYH1LENG8: 54 449 157–54 462 022, juoste eteenpäinLENG8LENG9: 54 461 732–54 463 778, juoste taaksepäinLENG9CDC42EP5: 54 465 026–54 473 316, juoste taaksepäinCDC42EP5LAIR2: 54 497 879–54 510 694, juoste eteenpäinLAIR2LILRA2: 54 572 920–54 590 287, juoste eteenpäinLILRA2LILRA1: 54 593 582–54 603 259, juoste eteenpäinLILRA1LILRB1: 54 616 309–54 638 022, juoste eteenpäinLILRB1LILRB4: 54 643 889–54 670 531, juoste eteenpäinLILRB4KIR3DL3: 54 724 442–54 736 632, juoste eteenpäinKIR3DL3KIR2DL3: 54 738 505–54 753 061, juoste eteenpäinKIR2DL3KIR2DL1: 54 769 793–54 784 332, juoste eteenpäinKIR2DL1KIR2DL4: 54 803 610–54 814 517, juoste eteenpäinKIR2DL4KIR3DL1: 54 816 440–54 830 778, juoste eteenpäinKIR3DL1KIR2DS4: 54 832 676–54 848 569, juoste eteenpäinKIR2DS4KIR3DL2: 54 850 433–54 867 209, juoste eteenpäinKIR3DL2LAIR1-kaavio: 10 eksonia kromosomin 19 juosteella, taaksepäinEkson 10: 54 351 384–54 355 414, 4 031 emästäEkson 9: 54 355 954–54 356 006, 53 emästäEkson 8: 54 356 230–54 356 267, 38 emästäEkson 7: 54 356 356–54 356 398, 43 emästäEkson 6: 54 356 491–54 356 619, 129 emästäEkson 5: 54 356 928–54 356 966, 39 emästäEkson 4: 54 360 022–54 360 072, 51 emästäEkson 3: 54 360 916–54 361 209, 294 emästäEkson 2: 54 364 295–54 364 330, 36 emästäEkson 1: 54 364 771–54 364 931, 161 emästä10864215′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 4,9 kb geenin 13,5 kb:stä; 864 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

LAIR1-geenin sekvensointi

7Helppo

Kuinka vaikea LAIR1-geeni on sekvensoida lyhyillä luennoilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki LAIR1-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joissa lyhyet luennat kohdistuvat selvästi.

Lisäksi vaikuttaa se, kuinka suuri osa LAIR1-geenin eksoneista sijaitsee kussakin vaikeassa alueessa.

  • Kartoitettavuus3,7 %
  • Homologia11 %
  • Toistot9 %
  • GC-pitoisuus9 %
  • Referenssin peittävyys0 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). LAIR1-geeni: leukocyte associated immunoglobulin like receptor 1. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/lair1

Vancouver

Dante Labs. LAIR1-geeni: leukocyte associated immunoglobulin like receptor 1 [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/lair1

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test