Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

CXCR3

C-X-C motif chemokine receptor 3

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
Xq13.1
Koordinaatit
Kromosomi X: 71 615 919–71 618 511 (GRCh38)
Eksonit
2 eksonia 2,6 kb:n alueella
Proteiini
368 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
CKR-L2, CMKAR3, IP10-R, MigR, CD183
Aiemmat symbolit
GPR9
MANE Select -transkripti
ENST00000373693.4NM_001504.2
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä CXCR3. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

CXCR3-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
Kromosomi X, jossa hakasulke osoittaa CXCR3-geenin sijainnin. CXCR3 ja 13 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa X, välillä 71 117 215–72 117 214.Kromosomi XXq13.1p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q2871,2 Mb71,4 Mb71,6 Mb71,8 Mb72 MbMED12: 71 118 543–71 144 103, juoste eteenpäinMED12NLGN3: 71 143 286–71 175 306, juoste eteenpäinNLGN3GJB1: 71 212 811–71 225 519, juoste eteenpäinGJB1ZMYM3: 71 239 617–71 255 269, juoste taaksepäinZMYM3NONO: 71 254 270–71 301 522, juoste eteenpäinNONOITGB1BP2: 71 301 717–71 305 371, juoste eteenpäinITGB1BP2TAF1: 71 366 129–71 532 374, juoste eteenpäinTAF1OGT: 71 533 068–71 575 892, juoste eteenpäinOGTGCNA: 71 578 436–71 613 590, juoste eteenpäinGCNACXCR3: 71 615 919–71 618 511, juoste taaksepäinCXCR3CXorf49C: 71 667 542–71 671 527, juoste eteenpäinCXorf49CCXorf49: 71 714 369–71 718 307, juoste taaksepäinCXorf49CXorf49B: 71 763 321–71 767 204, juoste eteenpäinCXorf49BNHSL2: 71 910 834–72 161 750, juoste eteenpäinNHSL2CXCR3-kaavio: 2 eksonia kromosomin X juosteella, taaksepäinEkson 2: 71 615 919–71 617 459, 1 541 emästäEkson 1: 71 618 438–71 618 511, 74 emästä215′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 1,6 kb geenin 2,6 kb:stä; 1 107 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Sekvensointi: CXCR3

6Helppo

Kuinka vaikea CXCR3 on sekvensoida lyhyin lukemin, asteikolla 0–100

Lähes kaikki geenin CXCR3 eksonit sijaitsevat alueilla, joilla lyhyet lukemat kartoittuvat selvästi.

Lisäksi vaikuttaa: geenin CXCR3 eksonien osuus kussakin vaikeassa alueluokassa

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Toistot5,1 %
  • GC-pitoisuus54 %
  • Referenssikattavuus0 %

Dante Labsin oman tutkimukseen perustuva pistemäärä, joka pohjautuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pistemäärä lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). CXCR3-geeni: C-X-C motif chemokine receptor 3. Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/cxcr3

Vancouver

Dante Labs. CXCR3-geeni: C-X-C motif chemokine receptor 3 [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/cxcr3

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test