Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

SNHG17

small nucleolar RNA host gene 17

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
20q11.23
Koordinaadid
Kromosoom 20: 38 420 588–38 435 328 (GRCh38)
Eksonid
8 eksonit, ulatus 14,7 kb
MANE Select transkript
ENST00000701521.2NR_185934.1
Lookuse tüüp
Pikk mittekodeeriv RNA (lncRNA)

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni SNHG17 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas SNHG17 on üles ehitatud

  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 20, millel on sulg kohal, kus asub SNHG17. SNHG17 ja sellele lähedal asuvad 14 geeni kromosoomil 20, vahemikus 37 927 958 kuni 38 927 957.Kromosoom 2020q11.23p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3338 Mb38,2 Mb38,4 Mb38,6 Mb38,8 MbVSTM2L: 37 902 987–37 945 354, otsene ahelVSTM2LTTI1: 37 983 007–38 033 461, pöördne ahelTTI1RPRD1B: 38 033 514–38 127 780, otsene ahelRPRD1BTGM2: 38 127 385–38 168 463, pöördne ahelTGM2KIAA1755: 38 210 503–38 261 039, pöördne ahelKIAA1755BPI: 38 260 141–38 337 505, otsene ahelBPILBP: 38 346 076–38 378 131, otsene ahelLBPSNHG17: 38 420 588–38 435 328, pöördne ahelSNHG17RALGAPB: 38 472 813–38 579 009, otsene ahelRALGAPBADIG: 38 581 180–38 588 463, otsene ahelADIGARHGAP40: 38 601 775–38 651 035, otsene ahelARHGAP40SLC32A1: 38 724 394–38 729 372, otsene ahelSLC32A1ACTR5: 38 748 196–38 774 861, otsene ahelACTR5PPP1R16B: 38 804 915–38 923 025, otsene ahelPPP1R16BSACK1D: 38 926 312–38 953 106, otsene ahelSACK1DSNHG17 skeem: 8 eksonit kromosoomi 20 pöördne ahelalEkson 8: 38 420 588–38 420 900, 313 alustEkson 7: 38 421 006–38 421 098, 93 alustEkson 6: 38 422 087–38 422 241, 155 alustEkson 5: 38 425 935–38 426 052, 118 alustEkson 4: 38 426 419–38 426 503, 85 alustEkson 3: 38 431 041–38 431 112, 72 alustEkson 2: 38 434 504–38 434 626, 123 alustEkson 1: 38 435 027–38 435 328, 302 alust876543215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 1,3 kb kogupikkusega 14,7 kb.

Sekveneerimine: SNHG17

8Lihtne

Kui raske on geeni SNHG17 lühikeste lugemitega järjestada, skaalal 0–100

Peaaegu kõik geeni SNHG17 eksonid asuvad kohtades, kuhu lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.

Lisaks mõjutab tulemust see, kui suur osa geeni SNHG17 eksonitest asub igat tüüpi rasketes piirkondades

  • Kaardistatavus0%
  • Homoloogia0%
  • Ühine chrY-ga0%
  • Viitekatvus0%
  • Kordused3,8%
  • GC-sisaldus34%

Dante Labsi skoor, mis põhineb meie enda uuringul ja NISTi Genome in a Bottle kaartidel raskesti järjestatavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). SNHG17 geen: small nucleolar RNA host gene 17. Vaadatud 21. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/snhg17

Vancouver

Dante Labs. SNHG17 geen: small nucleolar RNA host gene 17 [Internet]. [viidatud 21. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/snhg17

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test