Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

SNHG17

small nucleolar RNA host gene 17

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
20q11.23
Koordinaatit
Kromosomi 20: 38 420 588–38 435 328 (GRCh38)
Eksonit
8 eksonia 14,7 kb:n alueella
MANE Select -transkripti
ENST00000701521.2NR_185934.1
Lokustyyppi
Pitkä ei-koodaava RNA (lncRNA)

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä SNHG17. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

SNHG17-geenin rakenne

  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 20, jossa hakasulke osoittaa SNHG17-geenin sijainnin. SNHG17 ja 14 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 20, välillä 37 927 958–38 927 957.Kromosomi 2020q11.23p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3338 Mb38,2 Mb38,4 Mb38,6 Mb38,8 MbVSTM2L: 37 902 987–37 945 354, juoste eteenpäinVSTM2LTTI1: 37 983 007–38 033 461, juoste taaksepäinTTI1RPRD1B: 38 033 514–38 127 780, juoste eteenpäinRPRD1BTGM2: 38 127 385–38 168 463, juoste taaksepäinTGM2KIAA1755: 38 210 503–38 261 039, juoste taaksepäinKIAA1755BPI: 38 260 141–38 337 505, juoste eteenpäinBPILBP: 38 346 076–38 378 131, juoste eteenpäinLBPSNHG17: 38 420 588–38 435 328, juoste taaksepäinSNHG17RALGAPB: 38 472 813–38 579 009, juoste eteenpäinRALGAPBADIG: 38 581 180–38 588 463, juoste eteenpäinADIGARHGAP40: 38 601 775–38 651 035, juoste eteenpäinARHGAP40SLC32A1: 38 724 394–38 729 372, juoste eteenpäinSLC32A1ACTR5: 38 748 196–38 774 861, juoste eteenpäinACTR5PPP1R16B: 38 804 915–38 923 025, juoste eteenpäinPPP1R16BSACK1D: 38 926 312–38 953 106, juoste eteenpäinSACK1DSNHG17-kaavio: 8 eksonia kromosomin 20 juosteella, taaksepäinEkson 8: 38 420 588–38 420 900, 313 emästäEkson 7: 38 421 006–38 421 098, 93 emästäEkson 6: 38 422 087–38 422 241, 155 emästäEkson 5: 38 425 935–38 426 052, 118 emästäEkson 4: 38 426 419–38 426 503, 85 emästäEkson 3: 38 431 041–38 431 112, 72 emästäEkson 2: 38 434 504–38 434 626, 123 emästäEkson 1: 38 435 027–38 435 328, 302 emästä876543215′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 1,3 kb geenin 14,7 kb:stä.

SNHG17-geenin sekvensointi

8Helppo

Kuinka vaikea SNHG17-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki SNHG17-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joihin lyhyet lukemat kohdistuvat selvästi.

Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa SNHG17-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Yhteinen chrY:n kanssa0 %
  • Referenssin kattavuus0 %
  • Toistot3,8 %
  • GC-pitoisuus34 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). SNHG17-geeni: small nucleolar RNA host gene 17. Haettu 20. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/snhg17

Vancouver

Dante Labs. SNHG17-geeni: small nucleolar RNA host gene 17 [Internet]. [viitattu 20. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/snhg17

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test