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Gen

SNHG17

small nucleolar RNA host gene 17

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
20q11.23
Koordinaten
Chromosom 20: 38.420.588–38.435.328 (GRCh38)
Exons
8 Exons über 14,7 kb
MANE-Select-Transkript
ENST00000701521.2NR_185934.1
Locus-Typ
Lange nichtkodierende RNA (lncRNA)

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet SNHG17 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von SNHG17

  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 20, mit einer Klammer, an der SNHG17 liegt. SNHG17 und 14 Gene in der Nähe auf Chromosom 20, von 37.927.958 bis 38.927.957.Chromosom 2020q11.23p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3338 Mb38,2 Mb38,4 Mb38,6 Mb38,8 MbVSTM2L: 37.902.987–37.945.354, Plus-StrangVSTM2LTTI1: 37.983.007–38.033.461, Minus-StrangTTI1RPRD1B: 38.033.514–38.127.780, Plus-StrangRPRD1BTGM2: 38.127.385–38.168.463, Minus-StrangTGM2KIAA1755: 38.210.503–38.261.039, Minus-StrangKIAA1755BPI: 38.260.141–38.337.505, Plus-StrangBPILBP: 38.346.076–38.378.131, Plus-StrangLBPSNHG17: 38.420.588–38.435.328, Minus-StrangSNHG17RALGAPB: 38.472.813–38.579.009, Plus-StrangRALGAPBADIG: 38.581.180–38.588.463, Plus-StrangADIGARHGAP40: 38.601.775–38.651.035, Plus-StrangARHGAP40SLC32A1: 38.724.394–38.729.372, Plus-StrangSLC32A1ACTR5: 38.748.196–38.774.861, Plus-StrangACTR5PPP1R16B: 38.804.915–38.923.025, Plus-StrangPPP1R16BSACK1D: 38.926.312–38.953.106, Plus-StrangSACK1DDiagramm von SNHG17: 8 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom 20Exon 8: 38.420.588–38.420.900, 313 BasenExon 7: 38.421.006–38.421.098, 93 BasenExon 6: 38.422.087–38.422.241, 155 BasenExon 5: 38.425.935–38.426.052, 118 BasenExon 4: 38.426.419–38.426.503, 85 BasenExon 3: 38.431.041–38.431.112, 72 BasenExon 2: 38.434.504–38.434.626, 123 BasenExon 1: 38.435.027–38.435.328, 302 Basen876543215′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 1,3 kb der 14,7 kb des Gens aus.

Sequenzierung von SNHG17

4Niedrig

Wie schwer SNHG17 mit Short Reads zu sequenzieren ist, von 100

  • Mappability0 %
  • Homologie0 %
  • Wiederholungen3,8 %
  • GC-Gehalt34 %
  • Referenzabdeckung0 %

Externe Links

Herkunft der Daten

  • HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
  • MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). SNHG17-Gen: small nucleolar RNA host gene 17. Abgerufen am 17. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/snhg17

Vancouver

Dante Labs. SNHG17-Gen: small nucleolar RNA host gene 17 [Internet]. [zitiert am 17. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/snhg17

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