Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

SLC48A1

solute carrier family 48 member 1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
12q13.11
Koordinaadid
Kromosoom 12: 47 773 238–47 782 751 (GRCh38)
Eksonid
3 eksonit, ulatus 9,5 kb
Valk
146 aminohapet
Tuntud ka kui
FLJ20489, hHRG-1, HRG1
MANE Select transkript
ENST00000442218.3NM_017842.3
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni SLC48A1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas SLC48A1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
Kromosoom 12, millel on sulg kohal, kus asub SLC48A1. SLC48A1 ja sellele lähedal asuvad 12 geeni kromosoomil 12, vahemikus 47 277 995 kuni 48 277 994.Kromosoom 1212q13.11p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3347,4 Mb47,6 Mb47,8 Mb48 Mb48,2 MbRPAP3: 47 660 814–47 706 038, pöördne ahelRPAP3ENDOU: 47 709 734–47 725 567, pöördne ahelENDOURAPGEF3: 47 734 180–47 771 040, pöördne ahelRAPGEF3SLC48A1: 47 773 238–47 782 751, otsene ahelSLC48A1HDAC7: 47 782 722–47 833 132, pöördne ahelHDAC7VDR: 47 841 537–47 943 048, pöördne ahelVDRTMEM106C: 47 963 543–47 970 504, otsene ahelTMEM106CCOL2A1: 47 972 967–48 004 689, pöördne ahelCOL2A1SENP1: 48 039 784–48 106 316, pöördne ahelSENP1PFKM: 48 105 139–48 152 487, otsene ahelPFKMASB8: 48 147 789–48 181 213, pöördne ahelASB8CCDC184: 48 183 644–48 185 926, otsene ahelCCDC184OR10AD1: 48 202 339–48 203 292, pöördne ahelOR10AD1SLC48A1 skeem: 3 eksonit kromosoomi 12 otsene ahelalEkson 1: 47 773 238–47 773 440, 203 alustEkson 2: 47 779 028–47 779 195, 168 alustEkson 3: 47 780 145–47 782 751, 2607 alust1235′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 3 kb kogupikkusega 9,5 kb; neist 441 alust kodeerivad valku.

SLC48A1 sekveneerimine

2Kerge

Kui raske on geeni SLC48A1 lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 100-st

Peaaegu kõik geeni SLC48A1 eksonid asuvad kohtades, kus lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.

Mis seda veel suurendab: geeni SLC48A1 eksonite osa igat tüüpi rasketes piirkondades

  • Kaardistatavus0%
  • Homoloogia0%
  • Korduvused3,9%
  • GC-sisaldus14%
  • Referentskatvus0%

Dante Labsi skoor meie enda uurimistöö põhjal, mis tugineb NISTi Genome in a Bottle kaartidele raskesti sekveneeritavatest piirkondadest.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). SLC48A1 geen: solute carrier family 48 member 1. Vaadatud 18. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/slc48a1

Vancouver

Dante Labs. SLC48A1 geen: solute carrier family 48 member 1 [Internet]. [viidatud 18. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/slc48a1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test