Geen
DUSP29
dual specificity phosphatase 29
- HGNC 23481↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000188716↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 338599↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 10q22.2
- Koordinaadid
- Kromosoom 10: 75 037 472–75 073 642 (GRCh38)
- Eksonid
- 4 eksonit, ulatus 36,2 kb
- Valk
- 220 aminohapet
- Tuntud ka kui
- DUSP27
- Varasemad tähised
- DUPD1
- MANE Select transkript
- ENST00000338487.6NM_001003892.3
- Lookuse tüüp
- Valke kodeeriv
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/dusp29.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe DUSP29 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni DUSP29 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.
Kuidas DUSP29 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 1,1 kb kogupikkusega 36,2 kb; neist 663 alust kodeerivad valku.
DUSP29 sekveneerimine
5Lihtne
Kui raske on DUSP29 lühikeste lugemitega sekveneerida, skaalal 100-st
0 · Easy100 · Hard
Almost all of DUSP29's exons sit where short reads map cleanly.
What adds to it: the share of DUSP29's exons in each kind of hard region
- KaardistatavusLõigud, kus 100 või 250 aluspaari pikkuseid lugemeid ei saa üheselt paigutada, seega võib seal tuvastus puududa või olla vale. Kaal 35%.0%
- HomoloogiaSegmentaalsed duplikatsioonid: genoomi teised koopiad, nagu paraloogid ja pseudogeenid, vähemalt 90% identsusega. Kaal 30%.0%
- Korduvad järjestusedTandemkordused ja ühe aluse jooksud, millel lugemid libisevad ja mida need ei pruugi täielikult katta. Kaal 15%.4,9%
- GC-sisaldusAknad, kus G- ja C-aluseid on alla 25% või üle 65%, mida raamatukogu ettevalmistus katab hõredalt. Kaal 10%.44%
- Referentsi katvusLähedal asuvad lüngad referentskoostises, kus lugemitel pole joondamiseks järjestust. Kaal 10%.0%
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredIga riba näitab, kui suur osa geeni DUSP29 eksonite aluspaaridest asub sellist tüüpi raskes piirkonnas. Skoor kaalub neid selle järgi, kui palju iga tüüp lühikeste lugemite tuvastust takistab: 0, kui ükski alus ei asu üheski, ja 100, kui iga alus asub kõigis neist.
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). DUSP29 geen: dual specificity phosphatase 29. Vaadatud 18. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/dusp29
Dante Labs. DUSP29 geen: dual specificity phosphatase 29 [Internet]. [viidatud 18. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/dusp29
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast