Gen
RNU1-2
RNA, U1 small nuclear 2
- HGNC 10123↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000207005↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 26870↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- 1p36.13
- Coordenadas
- Cromosoma 1: 16.895.980–16.896.143 (GRCh38)
- Exones
- 1 exón en 0,2 kb
- También conocido como
- U1C1, U1C21
- Símbolos anteriores
- RNU1C1, RNU1C2
- Transcrito MANE Select
- ENST00000384278.1NR_004427.1
- Tipo de locus
- ARN nuclear pequeño (snRNA)
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Obtener mi Genome TestInformes revisados relevantes para este gen
Ningún informe de Genome Test lee aún RNU1-2. La prueba secuencia todo su genoma, así que sus datos lo incluyen igualmente.
Estructura de RNU1-2
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
- Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 0,2 kb de los 0,2 kb del gen.
Secuenciación de RNU1-2
81Difícil
Lo difícil que es secuenciar RNU1-2 con lecturas cortas, sobre 100
0 · Fácil100 · Difícil
Gran parte de RNU1-2 se encuentra en zonas donde las lecturas cortas pueden pasar por alto o colocar mal un cambio.
Lo que suma: la proporción de los exones de RNU1-2 en cada tipo de región difícil
- MapeabilidadTramos en los que las lecturas de 100 o 250 pb no pueden ubicarse de forma única, por lo que una llamada allí puede faltar o ser errónea. Peso 100 %.52 %
- HomologíaDuplicaciones segmentarias: copias en otras partes del genoma, como parálogos y pseudogenes, con una identidad del 90 % o más. Peso 60 %.100 %
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Peso 60 %.0 %
- Cobertura de referenciaHuecos cercanos en el ensamblaje de referencia, donde no hay secuencia con la que las lecturas puedan alinearse. Peso 50 %.0 %
- RepeticionesRepeticiones en tándem y tramos de una sola base, en los que las lecturas se deslizan y que puede que no abarquen. Peso 30 %.0 %
- Contenido GCVentanas con menos del 25 % o más del 65 % de G y C, que la preparación de la biblioteca cubre de forma deficiente. Peso 20 %.0 %
Una puntuación de Dante Labs basada en nuestra propia investigación, construida sobre los mapas de regiones difíciles de secuenciar Genome in a Bottle, del NIST.Cómo se puntúaCada barra es la proporción de las bases de los exones de RNU1-2 que se encuentran en ese tipo de región difícil. Cualquier tipo por sí solo puede hacer difícil un gen, y cada tipo adicional suma menos: 0 cuando ninguna base está en ninguno, 100 cuando todas las bases están donde las lecturas no pueden ubicarse de forma única.
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
De dónde procede
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su localización.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- Las estratificaciones del genoma de Genome in a Bottle, del NIST: la puntuación de dificultad de secuenciación.
Citar esta página
Dante Labs. (s. f.). Gen RNU1-2: RNA, U1 small nuclear 2. Consultado el 19 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/rnu1-2
Dante Labs. Gen RNU1-2: RNA, U1 small nuclear 2 [Internet]. [citado 19 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/rnu1-2
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