Gen
RNU1-2
RNA, U1 small nuclear 2
- HGNC 10123↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000207005↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 26870↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 1p36.13
- Współrzędne
- Chromosom 1: 16 895 980–16 896 143 (GRCh38)
- Eksony
- 1 ekson na odcinku 0,2 kb
- Znany również jako
- U1C1, U1C21
- Poprzednie symbole
- RNU1C1, RNU1C2
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000384278.1NR_004427.1
- Typ locus
- Mały jądrowy RNA (snRNA)
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rnu1-2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj RNU1-2 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu RNU1-2. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.
Budowa genu RNU1-2
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 0,2 kb z 0,2 kb genu.
Sekwencjonowanie RNU1-2
48Trudny
Stopień trudności sekwencjonowania genu RNU1-2 krótkimi odczytami w skali 0–100
0 · Łatwy100 · Trudny
Duża część genu RNU1-2 znajduje się w miejscach, gdzie krótkie odczyty mogą przeoczyć zmianę lub przypisać ją błędnie.
Co dokłada się do wyniku: udział eksonów genu RNU1-2 w każdym rodzaju trudnego regionu
- MapowalnośćFragmenty, w których odczytów o długości 100 lub 250 pz nie da się umieścić jednoznacznie, więc wywołanie wariantu może tam brakować lub być błędne. Waga 35%.52%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych częściach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub większej. Waga 30%.100%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednej zasady, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować w całości. Waga 15%.0%
- Zawartość GCOkna z mniej niż 25% lub więcej niż 65% zawartości G i C, które przygotowanie biblioteki pokrywa słabo. Waga 10%.0%
- Pokrycie referencjiLuki w pobliskim składzie sekwencji referencyjnej, gdzie nie ma sekwencji, do której odczyty mogłyby się dopasować. Waga 10%.0%
Wynik Dante Labs z własnych badań, oparty na mapach trudno sekwencjonowalnych regionów NIST Genome in a Bottle.Jak liczymy wynikKażdy słupek to udział zasad eksonów genu RNU1-2 w danym rodzaju trudnego regionu. Każdy rodzaj może sam w sobie uczynić gen trudnym, a każdy kolejny dodaje coraz mniej: 0, gdy żadna zasada nie leży w takim regionie, 100, gdy każda zasada znajduje się tam, gdzie odczytów nie da się umieścić jednoznacznie.
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Kliniczne
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen RNU1-2: RNA, U1 small nuclear 2. Pobrano 18 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/rnu1-2
Dante Labs. Gen RNU1-2: RNA, U1 small nuclear 2 [Internet]. [cytowano 18 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/rnu1-2
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni