Gen
RNU1-2
RNA, U1 small nuclear 2
- HGNC 10123↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000207005↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 26870↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 1p36.13
- Koordinater
- Kromosom 1: 16.895.980–16.896.143 (GRCh38)
- Exoner
- 1 exon fordelt over 0,2 kb
- Også kendt som
- U1C1, U1C21
- Tidligere symboler
- RNU1C1, RNU1C2
- MANE Select-transkript
- ENST00000384278.1NR_004427.1
- Lokustype
- Lille nuklear RNA (snRNA)
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rnu1-2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs RNU1-2 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Ingen Genome Test-rapport læser RNU1-2 endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.
Sådan er RNU1-2 opbygget
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 0,2 kb af genets 0,2 kb.
Sekventering af RNU1-2
48Svær
Hvor svær RNU1-2 er at sekventere med korte reads, ud af 100
0 · Let100 · Svær
En stor del af RNU1-2 ligger, hvor korte reads kan overse eller fejlplacere en ændring.
Det, der lægger oven i: andelen af RNU1-2s exons i hver type svær region
- KortlægbarhedStrækninger, hvor 100 eller 250 bp reads ikke kan placeres entydigt, så et kald der kan mangle eller være forkert. Vægt 35 %.52 %
- HomologiSegmentelle duplikationer: kopier andre steder i genomet, fx paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mere. Vægt 30 %.100 %
- GentagelserTandem-gentagelser og serier af én base, som reads glider på og måske ikke spænder over. Vægt 15 %.0 %
- GC-indholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dækker tyndt. Vægt 10 %.0 %
- ReferencedækningHuller i den nærliggende referencesamling, hvor der ikke findes nogen sekvens, som reads kan alignes til. Vægt 10 %.0 %
En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan scores detHver søjle er andelen af RNU1-2s exon-baser i den pågældende type svær region. Én type kan alene gøre et gen svært, og hver ekstra type tilføjer mindre: 0, når ingen base er i nogen, 100, når alle baser er der, hvor reads ikke kan placeres entydigt.
Eksterne links
Genposter
Transkript
Klinisk
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). RNU1-2-genet: RNA, U1 small nuclear 2. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/rnu1-2
Dante Labs. RNU1-2-genet: RNA, U1 small nuclear 2 [Internet]. [citeret 18. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/rnu1-2
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger