Gen
RNU1-1
RNA, U1 small nuclear 1
- HGNC 10120↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000206652↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 26871↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- 1p36.13
- Coordenadas
- Cromosoma 1: 16.514.122–16.514.285 (GRCh38)
- Exones
- 1 exón en 0,2 kb
- También conocido como
- Rnu1a1, U1, HU1-1, U1A1, HSD1
- Símbolos anteriores
- RNU1, RNU1G4, RNU1A3, RNU1A
- Transcrito MANE Select
- ENST00000383925.1NR_004430.4
- Tipo de locus
- ARN nuclear pequeño (snRNA)
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Ningún informe de Genome Test lee aún RNU1-1. La prueba secuencia todo su genoma, así que sus datos lo incluyen igualmente.
Estructura de RNU1-1
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
- Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 0,2 kb de los 0,2 kb del gen.
Secuenciación de RNU1-1
100Difícil
Dificultad de secuenciar RNU1-1 con lecturas cortas, sobre 100
0 · Fácil100 · Difícil
Gran parte de RNU1-1 se encuentra donde las lecturas cortas pueden pasar por alto o colocar mal un cambio.
Lo que lo agrava: la proporción de exones de RNU1-1 en cada tipo de región difícil
- MapeabilidadTramos en los que las lecturas de 100 o 250 pb no pueden ubicarse de forma única, por lo que una llamada allí puede faltar o ser errónea. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 100.100 %
- HomologíaDuplicaciones segmentarias: copias en otras partes del genoma, como parálogos y pseudogenes, con un 90 % de identidad o más. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 60.100 %
- Compartido con chrYLas regiones pseudoautosómicas y la región transpuesta de X, donde chrX y chrY tienen la misma secuencia o casi la misma, por lo que una lectura de uno puede ubicarse en el otro. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 60.0 %
- Cobertura de referenciaHuecos cercanos en el ensamblaje de referencia, donde no hay secuencia a la que las lecturas puedan alinearse. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 50.0 %
- RepeticionesRepeticiones en tándem y tramos de una sola base, en los que las lecturas se deslizan y pueden no abarcarlos. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 30.0 %
- Contenido GCVentanas con menos del 25 % o más del 65 % de G y C, que la preparación de la biblioteca cubre de forma escasa. Por sí solo, un gen completamente incluido en este tipo de región obtendría 20.0 %
Una puntuación de Dante Labs basada en investigación propia, construida sobre los mapas de regiones de difícil secuenciación Genome in a Bottle del NIST.Cómo se puntúaCada barra es la proporción de las bases de exones de RNU1-1 que están en ese tipo de región difícil. Cualquier tipo puede por sí solo hacer difícil un gen, y cada tipo adicional suma menos: 0 cuando ninguna base está en ninguno, 100 cuando todas las bases están donde las lecturas no pueden ubicarse de forma única.
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
De dónde procede
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su localización.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- Las estratificaciones del genoma de Genome in a Bottle, del NIST: la puntuación de dificultad de secuenciación.
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Dante Labs. (s. f.). Gen RNU1-1: RNA, U1 small nuclear 1. Consultado el 20 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/rnu1-1
Dante Labs. Gen RNU1-1: RNA, U1 small nuclear 1 [Internet]. [citado 20 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/rnu1-1
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