Genă
RNU1-1
RNA, U1 small nuclear 1
- HGNC 10120↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000206652↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 26871↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 1p36.13
- Coordonate
- Cromozomul 1: 16.514.122–16.514.285 (GRCh38)
- Exoni
- 1 exon pe 0,2 kb
- Denumiri alternative
- Rnu1a1, U1, HU1-1, U1A1, HSD1
- Simboluri anterioare
- RNU1, RNU1G4, RNU1A3, RNU1A
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000383925.1NR_004430.4
- Tip de locus
- ARN nuclear mic (snRNA)
Această pagină ca date
Adăugați .json la adresa paginii sau solicitați application/json pentru a o citi ca JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rnu1-1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameCitiți RNU1-1 și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRapoarte curatoriate relevante pentru această genă
Niciun raport Genome Test nu citește încă RNU1-1. Testul secvențiază întregul dumneavoastră genom, deci datele dumneavoastră includ totuși și această genă.
Structura genei RNU1-1
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
- Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 0,2 kb din cei 0,2 kb ai genei.
Secvențierea RNU1-1
65Ridicat
Cât de greu este de secvențiat RNU1-1 cu citiri scurte, din 100Fiecare bară reprezintă proporția bazelor exonice ale RNU1-1 aflate în acest tip de regiune dificilă. Scorul le ponderează în funcție de cât de mult afectează fiecare dintre ele apelul din citiri scurte: 0 când nicio bază nu se află în nicio regiune, 100 când fiecare bază se află în toate.
- MapabilitatePorțiuni în care citirile de 100 sau 250 bp nu pot fi plasate unic, deci un apel acolo poate lipsi sau poate fi greșit. Greutate 35 %.100 %
- OmologieDuplicări segmentare: copii în alte părți ale genomului, precum paralogii și pseudogenele, cu o identitate de 90% sau mai mare. Greutate 30 %.100 %
- RepetițiiRepetiții în tandem și secvențe de o singură bază, pe care citirile alunecă și pe care s-ar putea să nu le acopere. Greutate 15 %.0 %
- Conținut GCFerestre cu sub 25% sau peste 65% G și C, zone pe care pregătirea bibliotecii le acoperă slab. Greutate 10 %.0 %
- Acoperirea referințeiGoluri în asamblarea de referință din apropiere, unde nu există nicio secvență la care citirile să se poată alinia. Greutate 10 %.0 %
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
De unde provin aceste date
- HGNC: simbolul genei, denumirea, celelalte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- Stratificările genomului Genome in a Bottle, de la NIST: scorul de dificultate a secvențierii.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena RNU1-1: RNA, U1 small nuclear 1. Accesat 17 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/rnu1-1
Dante Labs. Gena RNU1-1: RNA, U1 small nuclear 1 [Internet]. [citat 17 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/rnu1-1
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni