AtlasGen
ZFP36L2
ZFP36 like 2 zinc finger CCCH-type
- HGNC 1108↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000152518↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 678↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 2p21
- Koordinater
- Kromosom 2: 43.222.402–43.226.606 (GRCh38)
- Exoner
- 2 exoner fordelt over 4,2 kb
- Protein
- 494 aminosyrer
- Også kendt som
- ERF2, TIS11D
- Tidligere symboler
- BRF2
- MANE Select-transkript
- ENST00000282388.4NM_006887.5
- Lokustype
- Proteinkodende
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
AtlasDenne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/zfp36l2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs ZFP36L2 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Ingen Genome Test-rapport læser ZFP36L2 endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.
Sådan er ZFP36L2 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 3,7 kb af genets 4,2 kb; 1.485 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af ZFP36L2
7Let
Hvor svær ZFP36L2 er at sekventere med korte reads, ud af 100
0 · Let100 · Svær
Næsten alle ZFP36L2s exons ligger, hvor korte reads kan kortlægges tydeligt.
Det, der lægger oven i: andelen af ZFP36L2s exons i hver type svær region
- KortlægbarhedStrækninger, hvor 100 eller 250 bp reads ikke kan placeres entydigt, så et kald der kan mangle eller være forkert. Vægt 35 %.0 %
- HomologiSegmentelle duplikationer: kopier andre steder i genomet, fx paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mere. Vægt 30 %.0 %
- GentagelserTandem-gentagelser og serier af én base, som reads glider på og måske ikke spænder over. Vægt 15 %.11 %
- GC-indholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dækker tyndt. Vægt 10 %.55 %
- ReferencedækningHuller i den nærliggende referencesamling, hvor der ikke findes nogen sekvens, som reads kan alignes til. Vægt 10 %.0 %
En Dante Labs-score baseret på vores egen forskning, bygget på NIST's Genome in a Bottle-kort over svært sekventerbare regioner.Sådan scores detHver søjle er andelen af ZFP36L2s exon-baser i den pågældende type svær region. Én type kan alene gøre et gen svært, og hver ekstra type tilføjer mindre: 0, når ingen base er i nogen, 100, når alle baser er der, hvor reads ikke kan placeres entydigt.
1
position i ZFP36L2, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte reads har svært ved at finde.
En hel genomsekventering dækker alle 4,2 kb af ZFP36L2, inklusive introns, og ikke kun de 3,7 kb af exons.
ClinVar pathogenic variants (1)
The ZFP36L2 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Sandsynligvis patogen 1
| Variant | Conditions | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_006887.5(ZFP36L2):c.922_930del (p.Ser308_Ser310del) (opens in a new tab) | oocyte maturation defect 13 | Sandsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
Træk knyttet til ZFP36L2
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, ZFP36L2 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende steder og de regioner, som korte læsninger har svært ved.
- Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.17-8666dff2.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). ZFP36L2-genet: ZFP36 like 2 zinc finger CCCH-type. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/zfp36l2
Dante Labs. ZFP36L2-genet: ZFP36 like 2 zinc finger CCCH-type [Internet]. [citeret 18. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/zfp36l2
AtlasÉn test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger