Gen
RNU4-1
RNA, U4 small nuclear 1
- HGNC 10192↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000200795↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 26835↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 12q24.31
- Koordinater
- Kromosom 12: 120.293.093–120.293.237 (GRCh38)
- Exoner
- 1 exon fordelt over 0,1 kb
- Også kendt som
- U4BL, U4
- Tidligere symboler
- RNU4B2, RNU4A
- MANE Select-transkript
- ENST00000363925.2NR_003925.2
- Lokustype
- Lille nuklear RNA (snRNA)
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rnu4-1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs RNU4-1 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Ingen Genome Test-rapport læser RNU4-1 endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.
Sådan er RNU4-1 opbygget
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 0,1 kb af genets 0,1 kb.
Sekventering af RNU4-1
0Let
Hvor svært RNU4-1 er at sekventere med korte reads, ud af 100
0 · Easy100 · Hard
Almost all of RNU4-1's exons sit where short reads map cleanly.
What adds to it: the share of RNU4-1's exons in each kind of hard region
- MappabilityStrækninger, hvor reads på 100 eller 250 bp ikke kan placeres entydigt, så et kald der kan mangle eller være forkert. Vægt 35 %.0 %
- HomologiSegmentale duplikationer: kopier andre steder i genomet, fx paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mere. Vægt 30 %.0 %
- GentagelserTandemgentagelser og løb af en enkelt base, som reads glider på og måske ikke spænder over. Vægt 15 %.0 %
- GC-indholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dækker tyndt. Vægt 10 %.0 %
- ReferencedækningHuller i referenceassemblyet i nærheden, hvor der ikke er nogen sekvens, reads kan justeres op mod. Vægt 10 %.0 %
A Dante Labs score from our own research, built on NIST's Genome in a Bottle maps of hard-to-sequence regions.How it's scoredHver søjle er andelen af RNU4-1s eksonbaser i den pågældende type svært område. Scoren vægter dem efter, hvor meget hver enkelt koster et kald med korte reads: 0, når ingen base er i nogen, 100, når alle baser er i alle.
1
position i RNU4-1, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i et område, som korte reads har svært ved.
En helgenomsekventering dækker alle 0,1 kb af RNU4-1, inklusive introner, og ikke kun de 0,1 kb eksoner.
ClinVar pathogenic variants (1)
The RNU4-1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 1
| Variant | Conditions | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|
| NR_003137.3(RNU4-2):n.64_65insT (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with hypotonia, brain anomalies, distinctive facies, and absent language | Patogen | ★★★★2 stjerner ud af 4 Kriterier angivet, flere indsendere, ingen konflikter |
Eksterne links
Genposter
Transkript
Hvor det kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende steder og de regioner, som korte læsninger har svært ved.
- Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
- Dataudgivelse 2026.10.17-8666dff2.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). RNU4-1-genet: RNA, U4 small nuclear 1. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/rnu4-1
Dante Labs. RNU4-1-genet: RNA, U4 small nuclear 1 [Internet]. [citeret 18. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/rnu4-1
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger