Gå til indhold
Brug dine HSA- eller FSA-midler
Sekvenér dit genom (åbnes i en ny fane)

Gen

RETREG3

reticulophagy regulator family member 3

Oversigt

Cytogenetisk placering
17q21.2
Koordinater
Kromosom 17: 42.579.515–42.609.374 (GRCh38)
Exoner
9 exoner fordelt over 29,9 kb
Protein
466 aminosyrer
Også kendt som
DKFZp686B1036, FLJ33806
Tidligere symboler
FAM134C
MANE Select-transkript
ENST00000309428.10NM_178126.4
Lokustype
Proteinkodende
  • Meget høj
  • Sikker
  • Lav
  • Meget lav

Kurerede rapporter relevant for dette gen

Ingen Genome Test-rapport læser RETREG3 endnu. Testen sekventerer hele dit genom, så dine data omfatter det alligevel.

Sådan er RETREG3 opbygget

  • Kodende sekvens
  • Utranslateret region
  • Intron
  • Transkriptionsretning
  • Regioner, som korte læsninger har svært ved
Kromosom 17, med en klamme ved RETREG3. RETREG3 og 44 gener i nærheden på kromosom 17, fra 42.094.445 til 43.094.444.Kromosom 1717q21.2p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.342,2 Mb42,4 Mb42,6 Mb42,8 Mb43 MbZNF385C: 42.025.576–42.098.479, omvendt-strengDHX58: 42.101.404–42.112.735, omvendt-strengKAT2A: 42.113.109–42.121.382, omvendt-streng: 42.119.674–42.154.916, omvendt-strengHSPB9: 42.122.804–42.123.352, fremadrettet-strengHSPB9RAB5C: 42.124.976–42.155.044, omvendt-strengRAB5CKCNH4: 42.156.891–42.181.146, omvendt-strengKCNH4HCRT: 42.184.060–42.185.452, omvendt-strengHCRTGHDC: 42.188.799–42.194.513, omvendt-strengGHDCSTAT5B: 42.199.176–42.288.633, omvendt-strengSTAT5BSTAT5A: 42.287.547–42.311.943, fremadrettet-strengSTAT5ASTAT3: 42.313.322–42.388.574, omvendt-strengSTAT3CAVIN1: 42.402.449–42.423.322, omvendt-strengCAVIN1ATP6V0A1: 42.458.823–42.522.582, fremadrettet-strengATP6V0A1NAGLU: 42.536.216–42.544.449, fremadrettet-strengHSD17B1: 42.552.920–42.555.217, fremadrettet-strengCOASY: 42.561.467–42.566.277, fremadrettet-strengMLX: 42.567.067–42.573.239, fremadrettet-strengMLXPSMC3IP: 42.572.310–42.577.831, omvendt-strengPSMC3IPRETREG3: 42.579.515–42.609.374, omvendt-strengRETREG3TUBG1: 42.609.411–42.615.253, fremadrettet-strengTUBG1TUBG2: 42.659.223–42.667.007, fremadrettet-strengTUBG2PLEKHH3: 42.667.914–42.677.064, omvendt-strengPLEKHH3CCR10: 42.678.889–42.683.917, omvendt-strengCCR10CNTNAP1: 42.682.368–42.699.993, fremadrettet-strengCNTNAP1EZH1: 42.700.270–42.745.069, omvendt-strengEZH1RAMP2: 42.758.447–42.763.537, fremadrettet-strengRAMP2VPS25: 42.773.439–42.779.600, fremadrettet-strengVPS25WNK4: 42.780.593–42.797.066, fremadrettet-strengWNK4COA3: 42.793.154–42.798.719, omvendt-strengCOA3CNTD1: 42.798.800–42.811.587, fremadrettet-strengBECN1: 42.809.108–42.833.350, omvendt-strengBECN1PSME3: 42.824.385–42.843.760, fremadrettet-strengAOC2: 42.844.574–42.850.707, fremadrettet-strengAOC2AOC3: 42.851.130–42.858.130, fremadrettet-strengAOC3G6PC1: 42.900.722–42.923.502, fremadrettet-strengG6PC1AARSD1: 42.950.424–42.964.498, omvendt-strengAARSD1PTGES3L-AARSD1: 42.950.526–42.980.528, omvendt-strengPTGES3L-AARSD1PTGES3L: 42.968.035–42.980.502, omvendt-strengPTGES3LRUNDC1: 42.980.552–42.995.142, fremadrettet-strengRUNDC1RPL27: 42.998.265–43.002.973, fremadrettet-strengVAT1: 42.999.182–43.025.123, omvendt-strengIFI35: 43.006.740–43.014.638, fremadrettet-strengRND2: 43.025.210–43.047.509, fremadrettet-strengBRCA1: 43.044.292–43.170.245, omvendt-strengBRCA1Diagram af RETREG3: 9 exoner på omvendt-strengen af kromosom 17Exon 9: 42.579.515–42.582.270, 2.756 baserExon 8: 42.582.674–42.582.806, 133 baserExon 7: 42.583.498–42.583.580, 83 baserExon 6: 42.585.125–42.585.262, 138 baserExon 5: 42.586.053–42.586.137, 85 baserExon 4: 42.586.765–42.586.891, 127 baserExon 3: 42.587.834–42.587.864, 31 baserExon 2: 42.592.056–42.592.162, 107 baserExon 1: 42.609.086–42.609.374, 289 baser9876543215′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.

Eksoner udgør 3,7 kb af genets 29,9 kb; 1.401 af disse baser koder for proteinet.

Sekventering af RETREG3

1Lav

Hvor svært RETREG3 er at sekventere med korte læsninger, på en skala fra 0 til 100

  • Mappabilitet0 %
  • Homologi0 %
  • Gentagelser3,9 %
  • GC-indhold7,7 %
  • Referencedækning0 %

1

position i RETREG3, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen

Ingen af dem ligger i et område, som korte læsninger har svært ved at læse.

En helgenomsekventering dækker alle 29,9 kb af RETREG3, inklusive introner, ikke kun de 3,7 kb af exoner.

Eksterne links

Hvor det kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
  • ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende steder og de regioner, som korte læsninger har svært ved.
  • Genome in a Bottle-genomstratifikationerne fra NIST: sekvenseringsvanskelighedsscoren.
  • Dataudgivelse 2026.10.17-8666dff2.

Citér denne side

APA

Dante Labs. (u.d.). RETREG3-genet: reticulophagy regulator family member 3. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/retreg3

Vancouver

Dante Labs. RETREG3-genet: reticulophagy regulator family member 3 [Internet]. [citeret 18. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/retreg3

Én test. Svar for hele livet.

Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger

Bestil min Genome Test