Gen
PLAGL1
PLAG1 like zinc finger 1
- HGNC 9046↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000118495↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 5325↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 6q24.2
- Koordinater
- Kromosom 6: 143 940 300–144 008 259 (GRCh38)
- Exoner
- 8 exoner på 68 kb
- Protein
- 463 aminosyror
- Även känd som
- ZAC, LOT1
- MANE Select-transkript
- ENST00000674357.1NM_001317162.2
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/plagl1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs PLAGL1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser PLAGL1 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är PLAGL1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 3,3 kb av genens 68 kb, och 1 392 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av PLAGL1
1Lätt
Hur svår PLAGL1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100
0 · Lätt100 · Svår
Nästan alla exoner i PLAGL1 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.
Det som adderar: andelen av PLAGL1:s exoner i varje typ av svårt område
- MappbarhetSträckor där 100 eller 250 bp långa läsningar inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 100 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 60 %.0 %
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Vikt 60 %.0 %
- ReferenstäckningLuckor i referensassemblyn i närheten, där det inte finns någon sekvens för läsningar att anpassas mot. Vikt 50 %.0 %
- RepetitionerTandemrepetitioner och serier av en och samma bas, som läsningar glider på och som kanske inte spänner över. Vikt 30 %.1,4 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksberedningen täcker tunnt. Vikt 20 %.5,2 %
En poäng från Dante Labs egen forskning, byggd på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade områden.Så beräknas poängenVarje stapel är andelen av PLAGL1:s exonbaser i just den typen av svårt område. Varje typ kan i sig göra en gen svår, och varje ytterligare typ adderar mindre: 0 när ingen bas ligger i någon, 100 när varje bas ligger där läsningar inte kan placeras entydigt.
Egenskaper kopplade till PLAGL1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som PLAGL1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of head or neck
- Abnormality of the face
- Abnormally large tongue
- Decreased depth of eye sockets
- Gum enlargement
- High palate
- Little lower jaw
- Prominent back of the head
- Prominent nose
Visa ytterligare 2 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). PLAGL1-genen: PLAG1 like zinc finger 1. Hämtad 19 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/plagl1
Dante Labs. PLAGL1-genen: PLAG1 like zinc finger 1 [Internet]. [citerad 19 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/plagl1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor