Gene
LRP1B
LDL receptor related protein 1B
- HGNC 6693↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000168702↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 53353↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 2q22.1-q22.2
- Coordenadas
- Cromossoma 2: 140 231 423–142 131 016 (GRCh38)
- Exões
- 91 exões ao longo de 1899,6 kb
- Proteína
- 4599 aminoácidos
- Também conhecido como
- LRP-DIT, LRPDIT
- Transcrito MANE Select
- ENST00000389484.8NM_018557.3
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
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page$gene$nameAnalise LRP1B, e o resto do seu genoma, com um único teste.
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Nenhum relatório do Genome Test analisa LRP1B ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.
Como LRP1B está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 15,9 kb dos 1899,6 kb do gene; 13 800 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de LRP1B
1Fácil
Dificuldade de sequenciação de LRP1B com leituras curtas, em 100
0 · Fácil100 · Difícil
Quase todos os exões de LRP1B se situam em zonas onde as leituras curtas se alinham com clareza.
O que acresce: a proporção dos exões de LRP1B em cada tipo de região difícil
- MapeabilidadeTrechos onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nessa zona pode estar em falta ou ser incorreta. Peso 35%.0%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutros pontos do genoma, como parálogos e pseudogenes, com identidade de 90% ou mais. Peso 30%.0%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, nas quais as leituras escorregam e podem não as abranger. Peso 15%.0,9%
- Conteúdo GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre de forma insuficiente. Peso 10%.6,1%
- Cobertura da referênciaLacunas nas proximidades na montagem de referência, onde não existe sequência à qual as leituras se possam alinhar. Peso 10%.0%
Uma pontuação da Dante Labs, baseada na nossa própria investigação e construída sobre os mapas de regiões de difícil sequenciação Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuaçãoCada barra representa a proporção das bases dos exões de LRP1B nesse tipo de região difícil. Qualquer tipo pode, por si só, tornar um gene difícil, e cada tipo adicional acrescenta menos: 0 quando nenhuma base está em nenhum, 100 quando todas as bases estão em regiões onde as leituras não podem ser posicionadas de forma única.
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
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Dante Labs. (s.d.). Gene LRP1B: LDL receptor related protein 1B. Consultado em 18 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/lrp1b
Dante Labs. Gene LRP1B: LDL receptor related protein 1B [Internet]. [consultado em 18 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/lrp1b
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