Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

LRP1B

LDL receptor related protein 1B

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
2q22.1-q22.2
Koordináták
2. kromoszóma: 140 231 423–142 131 016 (GRCh38)
Exonok
91 exon, összesen 1899,6 kb
Fehérje
4599 aminosav
Más néven ismert
LRP-DIT, LRPDIT
MANE Select transzkriptum
ENST00000389484.8NM_018557.3
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) LRP1B gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A LRP1B felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
2. kromoszóma, a LRP1B helyét zárójel jelöli. A LRP1B és környékén 5 gén a 2. kromoszómán, 138 331 829–144 030 610 között.2. kromoszóma2q22.1-q22.2p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.3139 Mb140 Mb141 Mb142 Mb143 Mb144 MbSPOPL: 138 494 828–138 574 458, előre szálSPOPLNXPH2: 138 669 157–138 780 909, fordított szálNXPH2LRP1B: 140 231 423–142 131 016, fordított szálLRP1BKYNU: 142 811 826–143 055 833, előre szálKYNUARHGAP15: 143 091 362–143 768 370, előre szálARHGAP15QTMAN: 143 938 068–144 333 107, fordított szálQTMANA LRP1B ábrája: 91 exon a(z) 2. kromoszóma fordított szálán91. exon: 140 231 423–140 233 326, 1904 bázis90. exon: 140 234 786–140 234 884, 99 bázis89. exon: 140 238 152–140 238 296, 145 bázis88. exon: 140 239 442–140 239 532, 91 bázis87. exon: 140 247 086–140 247 162, 77 bázis86. exon: 140 270 242–140 270 346, 105 bázis85. exon: 140 274 424–140 274 598, 175 bázis84. exon: 140 297 808–140 297 969, 162 bázis83. exon: 140 314 935–140 315 099, 165 bázis82. exon: 140 321 963–140 322 088, 126 bázis81. exon: 140 323 893–140 324 066, 174 bázis80. exon: 140 325 762–140 325 878, 117 bázis79. exon: 140 334 453–140 334 559, 107 bázis78. exon: 140 335 615–140 335 838, 224 bázis77. exon: 140 350 797–140 351 038, 242 bázis76. exon: 140 352 953–140 353 072, 120 bázis75. exon: 140 356 342–140 356 476, 135 bázis74. exon: 140 357 979–140 358 116, 138 bázis73. exon: 140 358 821–140 358 946, 126 bázis72. exon: 140 364 661–140 364 783, 123 bázis71. exon: 140 370 710–140 370 842, 133 bázis70. exon: 140 371 179–140 371 285, 107 bázis69. exon: 140 373 008–140 373 137, 130 bázis68. exon: 140 378 180–140 378 286, 107 bázis67. exon: 140 385 893–140 386 009, 117 bázis66. exon: 140 442 504–140 442 623, 120 bázis65. exon: 140 444 330–140 444 449, 120 bázis64. exon: 140 444 563–140 444 679, 117 bázis63. exon: 140 450 568–140 450 661, 94 bázis62. exon: 140 456 455–140 456 603, 149 bázis61. exon: 140 457 463–140 457 651, 189 bázis60. exon: 140 475 138–140 475 337, 200 bázis59. exon: 140 485 343–140 485 524, 182 bázis58. exon: 140 487 617–140 487 739, 123 bázis57. exon: 140 492 608–140 492 693, 86 bázis56. exon: 140 495 565–140 495 748, 184 bázis55. exon: 140 501 687–140 501 874, 188 bázis54. exon: 140 502 963–140 503 103, 141 bázis53. exon: 140 506 796–140 506 918, 123 bázis52. exon: 140 509 928–140 510 056, 129 bázis51. exon: 140 514 653–140 514 772, 120 bázis50. exon: 140 516 889–140 517 011, 123 bázis49. exon: 140 525 844–140 525 993, 150 bázis48. exon: 140 526 237–140 526 350, 114 bázis47. exon: 140 534 021–140 534 140, 120 bázis46. exon: 140 536 581–140 536 709, 129 bázis45. exon: 140 540 973–140 541 098, 126 bázis44. exon: 140 541 779–140 541 971, 193 bázis43. exon: 140 598 631–140 598 835, 205 bázis42. exon: 140 601 450–140 601 639, 190 bázis41. exon: 140 700 250–140 700 621, 372 bázis40. exon: 140 701 721–140 701 845, 125 bázis39. exon: 140 702 141–140 702 292, 152 bázis38. exon: 140 702 427–140 702 553, 127 bázis37. exon: 140 715 973–140 716 102, 130 bázis36. exon: 140 716 682–140 716 816, 135 bázis35. exon: 140 769 213–140 769 344, 132 bázis34. exon: 140 770 881–140 771 006, 126 bázis33. exon: 140 776 098–140 776 238, 141 bázis32. exon: 140 813 657–140 813 806, 150 bázis31. exon: 140 839 991–140 840 085, 95 bázis30. exon: 140 840 918–140 841 092, 175 bázis29. exon: 140 850 102–140 850 329, 228 bázis28. exon: 140 851 652–140 851 783, 132 bázis27. exon: 140 867 590–140 867 834, 245 bázis26. exon: 140 868 099–140 868 263, 165 bázis25. exon: 140 883 817–140 884 021, 205 bázis24. exon: 140 886 138–140 886 335, 198 bázis23. exon: 140 902 920–140 903 165, 246 bázis22. exon: 140 907 877–140 908 077, 201 bázis21. exon: 140 922 965–140 923 147, 183 bázis20. exon: 140 950 235–140 950 402, 168 bázis19. exon: 140 951 860–140 951 940, 81 bázis18. exon: 140 982 160–140 982 276, 117 bázis17. exon: 140 989 532–140 989 657, 126 bázis16. exon: 140 993 995–140 994 135, 141 bázis15. exon: 141 005 335–141 005 457, 123 bázis14. exon: 141 013 556–141 013 745, 190 bázis13. exon: 141 015 696–141 015 915, 220 bázis12. exon: 141 019 922–141 020 102, 181 bázis11. exon: 141 048 986–141 049 222, 237 bázis10. exon: 141 055 116–141 055 259, 144 bázis9. exon: 141 058 883–141 059 054, 172 bázis8. exon: 141 062 051–141 062 273, 223 bázis7. exon: 141 188 421–141 188 583, 163 bázis6. exon: 141 229 183–141 229 440, 258 bázis5. exon: 141 247 226–141 247 354, 129 bázis4. exon: 141 254 522–141 254 641, 120 bázis3. exon: 141 480 396–141 480 533, 138 bázis2. exon: 141 810 279–141 810 401, 123 bázis1. exon: 142 130 648–142 131 016, 369 bázis918060402015′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 1899,6 kb-jából 15,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 13 800 bázis kódolja a fehérjét.

LRP1B szekvenálása

1Könnyű

Mennyire nehéz a LRP1B szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A LRP1B exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ami tovább nehezíti: a LRP1B exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Ismétlődések0,9%
  • GC-tartalom6,1%
  • Referencia-lefedettség0%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). LRP1B gén: LDL receptor related protein 1B. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/lrp1b

Vancouver

Dante Labs. LRP1B gén: LDL receptor related protein 1B [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/lrp1b

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet