Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

LRP1B

LDL receptor related protein 1B

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
2q22.1-q22.2
Koordinaatit
Kromosomi 2: 140 231 423–142 131 016 (GRCh38)
Eksonit
91 eksonia 1 899,6 kb:n alueella
Proteiini
4 599 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
LRP-DIT, LRPDIT
MANE Select -transkripti
ENST00000389484.8NM_018557.3
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä LRP1B. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

LRP1B-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 2, jossa hakasulke osoittaa LRP1B-geenin sijainnin. LRP1B ja 5 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 2, välillä 138 331 829–144 030 610.Kromosomi 22q22.1-q22.2p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.3139 Mb140 Mb141 Mb142 Mb143 Mb144 MbSPOPL: 138 494 828–138 574 458, juoste eteenpäinSPOPLNXPH2: 138 669 157–138 780 909, juoste taaksepäinNXPH2LRP1B: 140 231 423–142 131 016, juoste taaksepäinLRP1BKYNU: 142 811 826–143 055 833, juoste eteenpäinKYNUARHGAP15: 143 091 362–143 768 370, juoste eteenpäinARHGAP15QTMAN: 143 938 068–144 333 107, juoste taaksepäinQTMANLRP1B-kaavio: 91 eksonia kromosomin 2 juosteella, taaksepäinEkson 91: 140 231 423–140 233 326, 1 904 emästäEkson 90: 140 234 786–140 234 884, 99 emästäEkson 89: 140 238 152–140 238 296, 145 emästäEkson 88: 140 239 442–140 239 532, 91 emästäEkson 87: 140 247 086–140 247 162, 77 emästäEkson 86: 140 270 242–140 270 346, 105 emästäEkson 85: 140 274 424–140 274 598, 175 emästäEkson 84: 140 297 808–140 297 969, 162 emästäEkson 83: 140 314 935–140 315 099, 165 emästäEkson 82: 140 321 963–140 322 088, 126 emästäEkson 81: 140 323 893–140 324 066, 174 emästäEkson 80: 140 325 762–140 325 878, 117 emästäEkson 79: 140 334 453–140 334 559, 107 emästäEkson 78: 140 335 615–140 335 838, 224 emästäEkson 77: 140 350 797–140 351 038, 242 emästäEkson 76: 140 352 953–140 353 072, 120 emästäEkson 75: 140 356 342–140 356 476, 135 emästäEkson 74: 140 357 979–140 358 116, 138 emästäEkson 73: 140 358 821–140 358 946, 126 emästäEkson 72: 140 364 661–140 364 783, 123 emästäEkson 71: 140 370 710–140 370 842, 133 emästäEkson 70: 140 371 179–140 371 285, 107 emästäEkson 69: 140 373 008–140 373 137, 130 emästäEkson 68: 140 378 180–140 378 286, 107 emästäEkson 67: 140 385 893–140 386 009, 117 emästäEkson 66: 140 442 504–140 442 623, 120 emästäEkson 65: 140 444 330–140 444 449, 120 emästäEkson 64: 140 444 563–140 444 679, 117 emästäEkson 63: 140 450 568–140 450 661, 94 emästäEkson 62: 140 456 455–140 456 603, 149 emästäEkson 61: 140 457 463–140 457 651, 189 emästäEkson 60: 140 475 138–140 475 337, 200 emästäEkson 59: 140 485 343–140 485 524, 182 emästäEkson 58: 140 487 617–140 487 739, 123 emästäEkson 57: 140 492 608–140 492 693, 86 emästäEkson 56: 140 495 565–140 495 748, 184 emästäEkson 55: 140 501 687–140 501 874, 188 emästäEkson 54: 140 502 963–140 503 103, 141 emästäEkson 53: 140 506 796–140 506 918, 123 emästäEkson 52: 140 509 928–140 510 056, 129 emästäEkson 51: 140 514 653–140 514 772, 120 emästäEkson 50: 140 516 889–140 517 011, 123 emästäEkson 49: 140 525 844–140 525 993, 150 emästäEkson 48: 140 526 237–140 526 350, 114 emästäEkson 47: 140 534 021–140 534 140, 120 emästäEkson 46: 140 536 581–140 536 709, 129 emästäEkson 45: 140 540 973–140 541 098, 126 emästäEkson 44: 140 541 779–140 541 971, 193 emästäEkson 43: 140 598 631–140 598 835, 205 emästäEkson 42: 140 601 450–140 601 639, 190 emästäEkson 41: 140 700 250–140 700 621, 372 emästäEkson 40: 140 701 721–140 701 845, 125 emästäEkson 39: 140 702 141–140 702 292, 152 emästäEkson 38: 140 702 427–140 702 553, 127 emästäEkson 37: 140 715 973–140 716 102, 130 emästäEkson 36: 140 716 682–140 716 816, 135 emästäEkson 35: 140 769 213–140 769 344, 132 emästäEkson 34: 140 770 881–140 771 006, 126 emästäEkson 33: 140 776 098–140 776 238, 141 emästäEkson 32: 140 813 657–140 813 806, 150 emästäEkson 31: 140 839 991–140 840 085, 95 emästäEkson 30: 140 840 918–140 841 092, 175 emästäEkson 29: 140 850 102–140 850 329, 228 emästäEkson 28: 140 851 652–140 851 783, 132 emästäEkson 27: 140 867 590–140 867 834, 245 emästäEkson 26: 140 868 099–140 868 263, 165 emästäEkson 25: 140 883 817–140 884 021, 205 emästäEkson 24: 140 886 138–140 886 335, 198 emästäEkson 23: 140 902 920–140 903 165, 246 emästäEkson 22: 140 907 877–140 908 077, 201 emästäEkson 21: 140 922 965–140 923 147, 183 emästäEkson 20: 140 950 235–140 950 402, 168 emästäEkson 19: 140 951 860–140 951 940, 81 emästäEkson 18: 140 982 160–140 982 276, 117 emästäEkson 17: 140 989 532–140 989 657, 126 emästäEkson 16: 140 993 995–140 994 135, 141 emästäEkson 15: 141 005 335–141 005 457, 123 emästäEkson 14: 141 013 556–141 013 745, 190 emästäEkson 13: 141 015 696–141 015 915, 220 emästäEkson 12: 141 019 922–141 020 102, 181 emästäEkson 11: 141 048 986–141 049 222, 237 emästäEkson 10: 141 055 116–141 055 259, 144 emästäEkson 9: 141 058 883–141 059 054, 172 emästäEkson 8: 141 062 051–141 062 273, 223 emästäEkson 7: 141 188 421–141 188 583, 163 emästäEkson 6: 141 229 183–141 229 440, 258 emästäEkson 5: 141 247 226–141 247 354, 129 emästäEkson 4: 141 254 522–141 254 641, 120 emästäEkson 3: 141 480 396–141 480 533, 138 emästäEkson 2: 141 810 279–141 810 401, 123 emästäEkson 1: 142 130 648–142 131 016, 369 emästä918060402015′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 15,9 kb geenin 1 899,6 kb:stä; 13 800 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Sekvensointi: LRP1B

1Helppo

Kuinka vaikea LRP1B on sekvensoida lyhyin lukemin, asteikolla 0–100

Lähes kaikki geenin LRP1B eksonit sijaitsevat alueilla, joilla lyhyet lukemat kartoittuvat selvästi.

Lisäksi vaikuttaa: geenin LRP1B eksonien osuus kussakin vaikeassa alueluokassa

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Toistot0,9 %
  • GC-pitoisuus6,1 %
  • Referenssikattavuus0 %

Dante Labsin oman tutkimukseen perustuva pistemäärä, joka pohjautuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pistemäärä lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). LRP1B-geeni: LDL receptor related protein 1B. Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/lrp1b

Vancouver

Dante Labs. LRP1B-geeni: LDL receptor related protein 1B [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/lrp1b

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test