Gene
LINC00305
long independently transcribed non-coding RNA 305
- HGNC 28597↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000179676↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 221241↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 18q22.1
- Coordenadas
- Cromossoma 18: 64 079 995–64 149 088 (GRCh38)
- Exões
- 7 exões ao longo de 69,1 kb
- Também conhecido como
- MGC39571, HsT1235
- Símbolos anteriores
- C18orf20, NCRNA00305
- Transcrito MANE Select
- ENST00000669361.2NR_190189.1
- Tipo de locus
- RNA longo não codificante (lncRNA)
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
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Como LINC00305 está organizado
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 1,3 kb dos 69,1 kb do gene.
Sequenciação de LINC00305
0Baixo
Grau de dificuldade de sequenciar LINC00305 com leituras curtas, em 100Cada barra é a proporção das bases de exões de LINC00305 que estão nesse tipo de região difícil. A pontuação pondera-as pelo custo que cada uma tem para uma chamada de leituras curtas: 0 quando nenhuma base está em nenhuma, 100 quando todas as bases estão em todas elas.
- MapeabilidadeTrechos onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nessas zonas pode estar em falta ou estar errada. Peso 35%.0%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutras partes do genoma, como parálogos e pseudogenes, com 90% de identidade ou mais. Peso 30%.0%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, nas quais as leituras escorregam e podem não abranger. Peso 15%.0%
- Teor de GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre mal. Peso 10%.3,4%
- Cobertura de referênciaLacunas na montagem de referência próxima, onde não há sequência à qual as leituras possam alinhar-se. Peso 10%.0%
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene LINC00305: long independently transcribed non-coding RNA 305. Consultado em 17 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/linc00305
Dante Labs. Gene LINC00305: long independently transcribed non-coding RNA 305 [Internet]. [consultado em 17 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/linc00305
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