Genă
LINC00305
long independently transcribed non-coding RNA 305
- HGNC 28597↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000179676↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 221241↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 18q22.1
- Coordonate
- Cromozomul 18: 64.079.995–64.149.088 (GRCh38)
- Exoni
- 7 de exoni pe 69,1 kb
- Denumiri alternative
- MGC39571, HsT1235
- Simboluri anterioare
- C18orf20, NCRNA00305
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000669361.2NR_190189.1
- Tip de locus
- ARN lung necodificator (lncRNA)
- Foarte ridicată
- Ridicată
- Scăzută
- Foarte scăzută
Această pagină ca date
Adăugați .json la adresa paginii sau solicitați application/json pentru a o citi ca JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/linc00305.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameCitiți LINC00305 și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRapoarte curatoriate relevante pentru această genă
Niciun raport Genome Test nu citește încă LINC00305. Testul secvențiază întregul dumneavoastră genom, deci datele dumneavoastră includ totuși și această genă.
Structura genei LINC00305
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
- Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 1,3 kb din cei 69,1 kb ai genei.
Secvenţiere LINC00305
1Uşor
Cât de dificil este de secvenţiat LINC00305 cu citiri scurte, din 100
0 · Uşor100 · Dificil
Aproape toţi exonii genei LINC00305 se află în zone unde citirile scurte se aliniază curat.
Ce se adaugă: ponderea exonilor genei LINC00305 din fiecare tip de regiune dificilă
- MapabilitatePorţiuni în care citirile de 100 sau 250 bp nu pot fi plasate unic, astfel încât o apelare acolo poate lipsi sau fi greşită. Pondere 100 %.0 %
- OmologieDuplicări segmentare: copii în alte zone ale genomului, cum sunt paralogii şi pseudogenele, cu identitate de 90% sau mai mare. Pondere 60 %.0 %
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Pondere 60 %.0 %
- Acoperire de referinţăGoluri în asamblarea de referinţă din apropiere, unde nu există secvenţă la care citirile să se alinieze. Pondere 50 %.0 %
- RepetiţiiRepetiţii în tandem şi secvenţe de o singură bază, pe care citirile alunecă şi pe care s-ar putea să nu le acopere integral. Pondere 30 %.0 %
- Conţinut GCFerestre cu sub 25% sau peste 65% G şi C, pe care pregătirea bibliotecii le acoperă slab. Pondere 20 %.3,4 %
Un scor Dante Labs din cercetarea noastră proprie, construit pe hărţile Genome in a Bottle ale NIST pentru regiunile greu de secvenţiat.Cum se calculează scorulFiecare bară reprezintă proporţia bazelor din exonii genei LINC00305 aflate în acel tip de regiune dificilă. Oricare tip poate face singur o genă dificilă, iar fiecare tip suplimentar adaugă mai puţin: 0 când nicio bază nu se află în niciunul, 100 când fiecare bază se află acolo unde citirile nu pot fi plasate unic.
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
De unde provin aceste date
- HGNC: simbolul genei, denumirea, celelalte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- Stratificările genomului Genome in a Bottle, de la NIST: scorul de dificultate a secvențierii.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena LINC00305: long independently transcribed non-coding RNA 305. Accesat 19 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/linc00305
Dante Labs. Gena LINC00305: long independently transcribed non-coding RNA 305 [Internet]. [citat 19 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/linc00305
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni