Przejdź do treści
Skorzystaj ze środków HSA lub FSA
Zsekwencjonuj swój genom (otwiera się w nowej karcie)

Gen

CCDC88B

coiled-coil and HOOK domain protein 88B

Podsumowanie

Lokalizacja cytogenetyczna
11q13.1
Współrzędne
Chromosom 11: 64 340 204–64 357 534 (GRCh38)
Eksony
27 eksonów na odcinku 17,3 kb
Białko
1476 aminokwasów
Znany również jako
FLJ37970, BRLZ, HkRP3, FLJ00354, GIPIE
Poprzednie symbole
CCDC88
Transkrypt MANE Select
ENST00000356786.10NM_032251.6
Typ locus
Kodujące białko
  • Bardzo wysoka
  • Pewna
  • Niska
  • Bardzo niska

Wyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu

Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu CCDC88B. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.

Budowa genu CCDC88B

  • Sekwencja kodująca
  • Region nieulegający translacji
  • Intron
  • Kierunek transkrypcji
  • Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Chromosom 11, z nawiasem wskazującym położenie CCDC88B. CCDC88B i 34 genów w pobliżu na chromosomie 11, od 63 848 869 do 64 848 868.Chromosom 1111q13.1p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2564 Mb64,2 Mb64,4 Mb64,6 Mb64,8 MbMARK2: 63 838 852–63 911 020, nić dodatniejMARK2RCOR2: 63 910 992–63 919 787, nić ujemnejRCOR2NAA40: 63 938 669–63 957 324, nić dodatniejNAA40COX8A: 63 974 579–63 976 543, nić dodatniejCOX8AOTUB1: 63 985 853–64 001 811, nić dodatniejOTUB1MACROD1: 63 998 553–64 166 501, nić ujemnejMACROD1FLRT1: 64 035 757–64 119 403, nić dodatniejFLRT1STIP1: 64 185 272–64 204 549, nić dodatniejFERMT3: 64 205 926–64 223 896, nić dodatniejTRPT1: 64 223 799–64 226 823, nić ujemnejNUDT22: 64 225 941–64 230 686, nić dodatniejDNAJC4: 64 230 158–64 234 286, nić dodatniejVEGFB: 64 234 406–64 239 264, nić dodatniejVEGFBFKBP2: 64 241 003–64 244 583, nić dodatniejFKBP2: 64 241 095–64 244 583, nić dodatniejPPP1R14B: 64 244 478–64 246 956, nić ujemnejPLCB3: 64 251 498–64 269 424, nić dodatniejBAD: 64 269 828–64 291 946, nić ujemnejGPR137: 64 270 062–64 290 690, nić dodatniejKCNK4: 64 291 302–64 300 031, nić dodatniejKCNK4CATSPERZ: 64 300 338–64 304 770, nić dodatniejESRRA: 64 305 080–64 317 859, nić dodatniejTRMT112: 64 316 460–64 318 086, nić ujemnejTRMT112PRDX5: 64 317 977–64 321 827, nić dodatniejPRDX5CCDC88B: 64 340 204–64 357 534, nić dodatniejCCDC88BRPS6KA4: 64 359 134–64 372 215, nić dodatniejRPS6KA4SLC22A11: 64 555 632–64 572 875, nić dodatniejSLC22A11SLC22A12: 64 590 641–64 602 353, nić dodatniejSLC22A12NRXN2: 64 606 174–64 723 202, nić ujemnejNRXN2RASGRP2: 64 726 905–64 745 456, nić ujemnejRASGRP2PYGM: 64 746 389–64 759 990, nić ujemnejPYGMSF1: 64 764 605–64 778 802, nić ujemnejSF1MAP4K2: 64 784 918–64 803 245, nić ujemnejMAP4K2MEN1: 64 803 500–64 811 294, nić ujemnejMEN1CDC42BPG: 64 823 051–64 844 735, nić ujemnejCDC42BPGSchemat CCDC88B: 27 eksonów na nici dodatniej chromosomu 11Ekson 1: 64 340 204–64 340 326, 123 zasadEkson 2: 64 340 607–64 340 752, 146 zasadEkson 3: 64 340 907–64 341 018, 112 zasadEkson 4: 64 341 109–64 341 178, 70 zasadEkson 5: 64 341 270–64 341 328, 59 zasadEkson 6: 64 341 421–64 341 504, 84 zasadEkson 7: 64 341 599–64 341 742, 144 zasadEkson 8: 64 341 994–64 342 139, 146 zasadEkson 9: 64 342 294–64 342 375, 82 zasadEkson 10: 64 342 522–64 342 680, 159 zasadEkson 11: 64 343 179–64 343 325, 147 zasadEkson 12: 64 343 507–64 343 615, 109 zasadEkson 13: 64 343 778–64 343 914, 137 zasadEkson 14: 64 343 997–64 345 157, 1161 zasadEkson 15: 64 349 331–64 349 458, 128 zasadEkson 16: 64 349 551–64 349 668, 118 zasadEkson 17: 64 351 160–64 351 255, 96 zasadEkson 18: 64 351 476–64 351 616, 141 zasadEkson 19: 64 352 130–64 352 386, 257 zasadEkson 20: 64 352 744–64 352 887, 144 zasadEkson 21: 64 353 054–64 353 240, 187 zasadEkson 22: 64 353 351–64 353 496, 146 zasadEkson 23: 64 353 715–64 353 813, 99 zasadEkson 24: 64 354 004–64 354 170, 167 zasadEkson 25: 64 355 194–64 355 400, 207 zasadEkson 26: 64 355 560–64 355 628, 69 zasadEkson 27: 64 357 039–64 357 534, 496 zasad12468101214161820222426275′3′

Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.

Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.

Eksony stanowią 4,9 kb z 17,3 kb genu; 4431 z tych zasad kodują białko.

Sekwencjonowanie CCDC88B

9Niski

Jak trudno sekwencjonować CCDC88B krótkimi odczytami, w skali 0–100

  • Mapowalność0%
  • Homologia0%
  • Powtórzenia4,6%
  • Zawartość GC82%
  • Pokrycie referencyjne0%

Linki zewnętrzne

Skąd to pochodzi

  • HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
  • MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
  • Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.

Cytuj tę stronę

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen CCDC88B: coiled-coil and HOOK domain protein 88B. Pobrano 18 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/ccdc88b

Vancouver

Dante Labs. Gen CCDC88B: coiled-coil and HOOK domain protein 88B [Internet]. [cytowano 18 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/ccdc88b

Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.

Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni

Zamawiam Genome Test