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Gene

CCDC88B

coiled-coil and HOOK domain protein 88B

Sintesi

Localizzazione citogenetica
11q13.1
Coordinate
Cromosoma 11: 64.340.204–64.357.534 (GRCh38)
Esoni
27 esoni su 17,3 kb
Proteina
1476 amminoacidi
Noto anche come
FLJ37970, BRLZ, HkRP3, FLJ00354, GIPIE
Simboli precedenti
CCDC88
Trascritto MANE Select
ENST00000356786.10NM_032251.6
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

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Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora CCDC88B. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di CCDC88B

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 11, con una parentesi dove si trova CCDC88B. CCDC88B e 34 geni nelle vicinanze sul cromosoma 11, da 63.848.869 a 64.848.868.Cromosoma 1111q13.1p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2564 Mb64,2 Mb64,4 Mb64,6 Mb64,8 MbMARK2: 63.838.852–63.911.020, filamento direttoMARK2RCOR2: 63.910.992–63.919.787, filamento inversoRCOR2NAA40: 63.938.669–63.957.324, filamento direttoNAA40COX8A: 63.974.579–63.976.543, filamento direttoCOX8AOTUB1: 63.985.853–64.001.811, filamento direttoOTUB1MACROD1: 63.998.553–64.166.501, filamento inversoMACROD1FLRT1: 64.035.757–64.119.403, filamento direttoFLRT1STIP1: 64.185.272–64.204.549, filamento direttoFERMT3: 64.205.926–64.223.896, filamento direttoTRPT1: 64.223.799–64.226.823, filamento inversoNUDT22: 64.225.941–64.230.686, filamento direttoDNAJC4: 64.230.158–64.234.286, filamento direttoVEGFB: 64.234.406–64.239.264, filamento direttoVEGFBFKBP2: 64.241.003–64.244.583, filamento direttoFKBP2: 64.241.095–64.244.583, filamento direttoPPP1R14B: 64.244.478–64.246.956, filamento inversoPLCB3: 64.251.498–64.269.424, filamento direttoBAD: 64.269.828–64.291.946, filamento inversoGPR137: 64.270.062–64.290.690, filamento direttoKCNK4: 64.291.302–64.300.031, filamento direttoKCNK4CATSPERZ: 64.300.338–64.304.770, filamento direttoESRRA: 64.305.080–64.317.859, filamento direttoTRMT112: 64.316.460–64.318.086, filamento inversoTRMT112PRDX5: 64.317.977–64.321.827, filamento direttoPRDX5CCDC88B: 64.340.204–64.357.534, filamento direttoCCDC88BRPS6KA4: 64.359.134–64.372.215, filamento direttoRPS6KA4SLC22A11: 64.555.632–64.572.875, filamento direttoSLC22A11SLC22A12: 64.590.641–64.602.353, filamento direttoSLC22A12NRXN2: 64.606.174–64.723.202, filamento inversoNRXN2RASGRP2: 64.726.905–64.745.456, filamento inversoRASGRP2PYGM: 64.746.389–64.759.990, filamento inversoPYGMSF1: 64.764.605–64.778.802, filamento inversoSF1MAP4K2: 64.784.918–64.803.245, filamento inversoMAP4K2MEN1: 64.803.500–64.811.294, filamento inversoMEN1CDC42BPG: 64.823.051–64.844.735, filamento inversoCDC42BPGDiagramma di CCDC88B: 27 esoni sul filamento diretto del cromosoma 11Esone 1: 64.340.204–64.340.326, 123 basiEsone 2: 64.340.607–64.340.752, 146 basiEsone 3: 64.340.907–64.341.018, 112 basiEsone 4: 64.341.109–64.341.178, 70 basiEsone 5: 64.341.270–64.341.328, 59 basiEsone 6: 64.341.421–64.341.504, 84 basiEsone 7: 64.341.599–64.341.742, 144 basiEsone 8: 64.341.994–64.342.139, 146 basiEsone 9: 64.342.294–64.342.375, 82 basiEsone 10: 64.342.522–64.342.680, 159 basiEsone 11: 64.343.179–64.343.325, 147 basiEsone 12: 64.343.507–64.343.615, 109 basiEsone 13: 64.343.778–64.343.914, 137 basiEsone 14: 64.343.997–64.345.157, 1161 basiEsone 15: 64.349.331–64.349.458, 128 basiEsone 16: 64.349.551–64.349.668, 118 basiEsone 17: 64.351.160–64.351.255, 96 basiEsone 18: 64.351.476–64.351.616, 141 basiEsone 19: 64.352.130–64.352.386, 257 basiEsone 20: 64.352.744–64.352.887, 144 basiEsone 21: 64.353.054–64.353.240, 187 basiEsone 22: 64.353.351–64.353.496, 146 basiEsone 23: 64.353.715–64.353.813, 99 basiEsone 24: 64.354.004–64.354.170, 167 basiEsone 25: 64.355.194–64.355.400, 207 basiEsone 26: 64.355.560–64.355.628, 69 basiEsone 27: 64.357.039–64.357.534, 496 basi12468101214161820222426275′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 4,9 kb dei 17,3 kb del gene; 4431 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene CCDC88B: coiled-coil and HOOK domain protein 88B. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/ccdc88b

Vancouver

Dante Labs. Gene CCDC88B: coiled-coil and HOOK domain protein 88B [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/ccdc88b

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