AtlasGen
POLR3GL
RNA polymerase III subunit GL
- HGNC 28466↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000121851↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 84265↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 1q21.1
- Koordinater
- Kromosom 1: 145 964 690–145 978 848 (GRCh38)
- Eksoner
- 8 eksoner over 14,2 kb
- Protein
- 218 aminosyrer
- Også kjent som
- flj32422, MGC3200
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000369314.2NM_032305.3
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
AtlasDenne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/polr3gl.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes POLR3GL og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Ingen Genome Test-rapport leser POLR3GL ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.
Slik er POLR3GL bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 1,2 kb av genets 14,2 kb, og 657 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av POLR3GL
4Lett
Hvor vanskelig POLR3GL er å sekvensere med korte leser, av 100
0 · Lett100 · Vanskelig
Nesten alle eksonene til POLR3GL ligger der korte leser kartlegges godt.
Det som bidrar: andelen av eksonene til POLR3GL i hver type vanskelig område
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, slik at en påvisning der kan mangle eller være feil. Vekt 100 %.0 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vekt 60 %.0 %
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Vekt 60 %.0 %
- ReferansedekningHull i den nærliggende referanseassembleringen, der det ikke finnes sekvens for leser å justere mot. Vekt 50 %.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser kan glippe på og kanskje ikke spenner over. Vekt 30 %.13 %
- GC-innholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som bibliotekforberedelsen dekker tynt. Vekt 20 %.0 %
En Dante Labs-score basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummenHver søyle er andelen av eksonbaser i POLR3GL i den typen vanskelig område. Én type kan i seg selv gjøre et gen vanskelig, og hver ekstra type bidrar mindre: 0 når ingen baser er i noen, 100 når alle baser ligger der leser ikke kan plasseres entydig.
Egenskaper knyttet til POLR3GL
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene POLR3GL kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). POLR3GL-genet: RNA polymerase III subunit GL. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/polr3gl
Dante Labs. POLR3GL-genet: RNA polymerase III subunit GL [Internett]. [sitert 19. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/polr3gl
AtlasÉn test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker