Genas
RNU5A-1
RNA, U5A small nuclear 1
- HGNC 10211↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000199568↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 26831↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 15q22.31
- Koordinatės
- Chromosoma 15: 65 296 051–65 296 167 (GRCh38)
- Eksonai
- 1 eksonas per 0,1 kb
- Taip pat žinomas kaip
- U5A, U5B1
- Ankstesni simboliai
- RNU5C, RNU5A
- MANE Select transkriptas
- ENST00000362698.2NR_002756.2
- Lokuso tipas
- Mažosios branduolio RNR (snRNR)
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rnu5a-1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite RNU5A-1 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Nė viena Genome Test ataskaita dar nenuskaito RNU5A-1 geno. Testas seka visą jūsų genomą, todėl jūsų duomenyse jis vis tiek yra.
Kaip išdėstytas RNU5A-1
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 0,1 kb iš 0,1 kb geno.
Sekoskaita: RNU5A-1
0Maža
Kiek sunku sekti RNU5A-1 trumpaisiais skaitiniais, iš 100Kiekvienas stulpelis rodo RNU5A-1 egzonų bazių dalį tokio tipo sunkiuose regionuose. Balas juos sveria pagal tai, kiek kiekvienas iš jų apsunkina trumpųjų skaitinių iškvietimą: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokį regioną, 100, kai kiekviena bazė patenka į visus jų.
- Atvaizdavimas į genomąRuožai, kuriuose 100 arba 250 bp skaitinių negali būti vienareikšmiškai įtvirtinti, todėl ten esantis rezultatas gali būti nerastas arba klaidingas. Svoris: 35 %.0 %
- HomologijaSegmentinės dublikacijos: kopijos kituose genomo vietose, pavyzdžiui paralogai ir pseudogenai, kai tapatumas 90 % ar didesnis. Svoris: 30 %.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido serijos, kuriose skaitiniai slysta ir gali neapimti. Svoris: 15 %.0 %
- GC kiekisLangai, kurių GC kiekis yra mažesnis nei 25 % arba didesnis nei 65 %, ir kuriuos bibliotekos paruošimas apima silpnai. Svoris: 10 %.0 %
- Nuorodinio genomo aprėptisSpragos nuorodinėje sekoje šalia, kur nėra sekos, prie kurios trumpieji skaitiniai galėtų prisijungti. Svoris: 10 %.0 %
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). RNU5A-1 genas: RNA, U5A small nuclear 1. Pasiekta 2026 m. spalio 18 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/rnu5a-1
Dante Labs. RNU5A-1 genas: RNA, U5A small nuclear 1 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 18 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/rnu5a-1
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites