Pereiti prie turinio
Naudokite savo HSA ar FSA lėšas
Sekvenuokite savo genomą (atsidaro naujame skirtuke)

Genas

PTPRD

protein tyrosine phosphatase receptor type D

Santrauka

Citogenetinė vieta
9p24.1-p23
Koordinatės
Chromosoma 9: 8 314 246–10 613 002 (GRCh38)
Eksonai
46 eksonų per 2 298,8 kb
Baltymas
1 912 aminorūgščių
Taip pat žinomas kaip
PTPD, HPTP
MANE Select transkriptas
ENST00000381196.9NM_002839.4
Lokuso tipas
Baltymus koduojantys
  • Labai aukštas
  • Patikimas
  • Žemas
  • Labai žemas

Kuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu

Nė viena Genome Test ataskaita dar nenuskaito PTPRD geno. Testas seka visą jūsų genomą, todėl jūsų duomenyse jis vis tiek yra.

Kaip išdėstytas PTPRD

  • Koduojanti seka
  • Netransliuojama sritis
  • Intronas
  • Transkripcijos kryptis
  • Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Chromosoma 9, su skliaustu, kur yra PTPRD. PTPRD ir dar 9 genų šalia jo chromosomoje 9, nuo 6 015 489 iki 12 911 759.Chromosoma 99p24.1-p23p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.37 Mb8 Mb9 Mb10 Mb11 Mb12 MbRANBP6: 6 011 025–6 015 639, atvirkštinė grandinėRANBP6IL33: 6 215 136–6 281 596, tiesioginė grandinėIL33TPD52L3: 6 328 375–6 331 891, tiesioginė grandinėTPD52L3UHRF2: 6 413 151–6 507 056, tiesioginė grandinėUHRF2GLDC: 6 532 464–6 645 734, atvirkštinė grandinėGLDCKDM4C: 6 720 863–7 175 648, tiesioginė grandinėKDM4CDMAC1: 7 796 489–7 888 380, atvirkštinė grandinėDMAC1PTPRD: 8 314 246–10 613 002, atvirkštinė grandinėPTPRDTYRP1: 12 333 995–12 710 597, tiesioginė grandinėTYRP1LURAP1L: 12 775 005–12 823 060, tiesioginė grandinėLURAP1LPTPRD diagrama: 46 eksonų, chromosoma 9, atvirkštinė grandisEksonas 46: 8 314 246–8 317 942, 3 697 baziųEksonas 45: 8 319 831–8 319 966, 136 baziųEksonas 44: 8 331 582–8 331 736, 155 baziųEksonas 43: 8 338 922–8 339 047, 126 baziųEksonas 42: 8 340 343–8 340 469, 127 baziųEksonas 41: 8 341 090–8 341 268, 179 baziųEksonas 40: 8 341 693–8 341 978, 286 baziųEksonas 39: 8 375 936–8 376 090, 155 baziųEksonas 38: 8 376 607–8 376 726, 120 baziųEksonas 37: 8 389 232–8 389 407, 176 baziųEksonas 36: 8 404 537–8 404 660, 124 baziųEksonas 35: 8 436 592–8 436 689, 98 baziųEksonas 34: 8 449 725–8 449 837, 113 baziųEksonas 33: 8 460 411–8 460 571, 161 bazėEksonas 32: 8 465 466–8 465 675, 210 baziųEksonas 31: 8 470 995–8 471 085, 91 bazėEksonas 30: 8 484 119–8 484 378, 260 baziųEksonas 29: 8 485 227–8 485 324, 98 baziųEksonas 28: 8 485 762–8 486 349, 588 baziųEksonas 27: 8 492 862–8 492 979, 118 baziųEksonas 26: 8 497 242–8 497 268, 27 baziųEksonas 25: 8 499 647–8 499 840, 194 baziųEksonas 24: 8 500 754–8 501 059, 306 baziųEksonas 23: 8 504 261–8 504 405, 145 baziųEksonas 22: 8 507 301–8 507 434, 134 baziųEksonas 21: 8 517 848–8 518 429, 582 baziųEksonas 20: 8 521 277–8 521 546, 270 baziųEksonas 19: 8 523 513–8 523 524, 12 baziųEksonas 18: 8 524 925–8 525 035, 111 baziųEksonas 17: 8 526 627–8 526 644, 18 baziųEksonas 16: 8 527 345–8 527 353, 9 baziųEksonas 15: 8 528 591–8 528 779, 189 baziųEksonas 14: 8 633 317–8 633 458, 142 baziųEksonas 13: 8 636 699–8 636 844, 146 baziųEksonas 12: 8 733 780–8 733 946, 167 baziųEksonas 11: 9 018 697–9 018 735, 39 baziųEksonas 10: 9 183 304–9 183 363, 60 baziųEksonas 9: 9 397 449–9 397 482, 34 baziųEksonas 8: 9 574 732–9 574 781, 50 baziųEksonas 7: 9 734 533–9 734 571, 39 baziųEksonas 6: 9 766 810–9 766 851, 42 baziųEksonas 5: 9 938 507–9 938 610, 104 baziųEksonas 4: 10 033 718–10 033 790, 73 baziųEksonas 3: 10 340 963–10 341 017, 55 baziųEksonas 2: 10 612 398–10 612 505, 108 baziųEksonas 1: 10 612 688–10 613 002, 315 bazių462515′3′

Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.

Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).

Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.

Eksonai sudaro 10,4 kb iš 2 298,8 kb geno; 5 739 šių bazių koduoja baltymą.

PTPRD sekvenavimas

3Lengva

Kaip sunku sekvenuoti PTPRD trumpaisiais skaitiniais, iš 100

Beveik visi PTPRD eksonai yra vietose, kur trumpieji skaitiniai atvaizduojami aiškiai.

Dar prisideda: kiekvienos rūšies sunkių sričių dalis tarp PTPRD eksonų

  • Atvaizduojamumas0 %
  • Homologija0 %
  • Bendra su chrY0 %
  • Nuorodinės sekos aprėptis0 %
  • Pasikartojimai4,9 %
  • GC kiekis6,5 %

„Dante Labs“ rezultatas, sudarytas remiantis mūsų pačių tyrimais ir NIST „Genome in a Bottle“ sunkiai sekvenuojamų sričių žemėlapiais.Kaip skaičiuojama

Išorinės nuorodos

Iš kur tai paimta

  • HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
  • MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
  • Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.

Cituoti šį puslapį

APA

Dante Labs. (be datos). PTPRD genas: protein tyrosine phosphatase receptor type D. Pasiekta 2026 m. spalio 21 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/ptprd

Vancouver

Dante Labs. PTPRD genas: protein tyrosine phosphatase receptor type D [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 21 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/ptprd

Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.

Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites

Įsigyti savo Genome Test