Przejdź do treści
Skorzystaj ze środków HSA lub FSA
Zsekwencjonuj swój genom (otwiera się w nowej karcie)

Gen

PTPRD

protein tyrosine phosphatase receptor type D

Podsumowanie

Lokalizacja cytogenetyczna
9p24.1-p23
Współrzędne
Chromosom 9: 8 314 246–10 613 002 (GRCh38)
Eksony
46 eksonów na odcinku 2298,8 kb
Białko
1912 aminokwasów
Znany również jako
PTPD, HPTP
Transkrypt MANE Select
ENST00000381196.9NM_002839.4
Typ locus
Kodujące białko
  • Bardzo wysoka
  • Pewna
  • Niska
  • Bardzo niska

Wyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu

Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu PTPRD. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.

Budowa genu PTPRD

  • Sekwencja kodująca
  • Region nieulegający translacji
  • Intron
  • Kierunek transkrypcji
  • Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Chromosom 9, z nawiasem wskazującym położenie PTPRD. PTPRD i 9 genów w pobliżu na chromosomie 9, od 6 015 489 do 12 911 759.Chromosom 99p24.1-p23p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.37 Mb8 Mb9 Mb10 Mb11 Mb12 MbRANBP6: 6 011 025–6 015 639, nić ujemnejRANBP6IL33: 6 215 136–6 281 596, nić dodatniejIL33TPD52L3: 6 328 375–6 331 891, nić dodatniejTPD52L3UHRF2: 6 413 151–6 507 056, nić dodatniejUHRF2GLDC: 6 532 464–6 645 734, nić ujemnejGLDCKDM4C: 6 720 863–7 175 648, nić dodatniejKDM4CDMAC1: 7 796 489–7 888 380, nić ujemnejDMAC1PTPRD: 8 314 246–10 613 002, nić ujemnejPTPRDTYRP1: 12 333 995–12 710 597, nić dodatniejTYRP1LURAP1L: 12 775 005–12 823 060, nić dodatniejLURAP1LSchemat PTPRD: 46 eksonów na nici ujemnej chromosomu 9Ekson 46: 8 314 246–8 317 942, 3697 zasadEkson 45: 8 319 831–8 319 966, 136 zasadEkson 44: 8 331 582–8 331 736, 155 zasadEkson 43: 8 338 922–8 339 047, 126 zasadEkson 42: 8 340 343–8 340 469, 127 zasadEkson 41: 8 341 090–8 341 268, 179 zasadEkson 40: 8 341 693–8 341 978, 286 zasadEkson 39: 8 375 936–8 376 090, 155 zasadEkson 38: 8 376 607–8 376 726, 120 zasadEkson 37: 8 389 232–8 389 407, 176 zasadEkson 36: 8 404 537–8 404 660, 124 zasadEkson 35: 8 436 592–8 436 689, 98 zasadEkson 34: 8 449 725–8 449 837, 113 zasadEkson 33: 8 460 411–8 460 571, 161 zasadEkson 32: 8 465 466–8 465 675, 210 zasadEkson 31: 8 470 995–8 471 085, 91 zasadEkson 30: 8 484 119–8 484 378, 260 zasadEkson 29: 8 485 227–8 485 324, 98 zasadEkson 28: 8 485 762–8 486 349, 588 zasadEkson 27: 8 492 862–8 492 979, 118 zasadEkson 26: 8 497 242–8 497 268, 27 zasadEkson 25: 8 499 647–8 499 840, 194 zasadEkson 24: 8 500 754–8 501 059, 306 zasadEkson 23: 8 504 261–8 504 405, 145 zasadEkson 22: 8 507 301–8 507 434, 134 zasadEkson 21: 8 517 848–8 518 429, 582 zasadEkson 20: 8 521 277–8 521 546, 270 zasadEkson 19: 8 523 513–8 523 524, 12 zasadEkson 18: 8 524 925–8 525 035, 111 zasadEkson 17: 8 526 627–8 526 644, 18 zasadEkson 16: 8 527 345–8 527 353, 9 zasadEkson 15: 8 528 591–8 528 779, 189 zasadEkson 14: 8 633 317–8 633 458, 142 zasadEkson 13: 8 636 699–8 636 844, 146 zasadEkson 12: 8 733 780–8 733 946, 167 zasadEkson 11: 9 018 697–9 018 735, 39 zasadEkson 10: 9 183 304–9 183 363, 60 zasadEkson 9: 9 397 449–9 397 482, 34 zasadEkson 8: 9 574 732–9 574 781, 50 zasadEkson 7: 9 734 533–9 734 571, 39 zasadEkson 6: 9 766 810–9 766 851, 42 zasadEkson 5: 9 938 507–9 938 610, 104 zasadEkson 4: 10 033 718–10 033 790, 73 zasadEkson 3: 10 340 963–10 341 017, 55 zasadEkson 2: 10 612 398–10 612 505, 108 zasadEkson 1: 10 612 688–10 613 002, 315 zasad462515′3′

Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.

Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.

Eksony stanowią 10,4 kb z 2298,8 kb genu; 5739 z tych zasad kodują białko.

Sekwencjonowanie PTPRD

3Łatwo

Jak trudno zsekwencjonować PTPRD krótkimi odczytami, w skali do 100

Niemal wszystkie eksony PTPRD znajdują się w miejscach, które krótkie odczyty mapują bez problemu.

Co na to wpływa: udział eksonów PTPRD w każdym rodzaju trudnego regionu

  • Mapowalność0%
  • Homologia0%
  • Wspólne z chrY0%
  • Pokrycie sekwencji referencyjnej0%
  • Powtórzenia4,9%
  • Zawartość GC6,5%

Wynik Dante Labs z naszych własnych badań, oparty na mapach trudnych do zsekwencjonowania regionów Genome in a Bottle z NIST.Jak obliczany jest wynik

Linki zewnętrzne

Skąd to pochodzi

  • HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
  • MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
  • Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.

Cytuj tę stronę

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen PTPRD: protein tyrosine phosphatase receptor type D. Pobrano 21 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/ptprd

Vancouver

Dante Labs. Gen PTPRD: protein tyrosine phosphatase receptor type D [Internet]. [cytowano 21 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/ptprd

Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.

Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni

Zamawiam Genome Test