Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

TM4SF20

transmembrane 4 L six family member 20

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
2q36.3
Koordináták
2. kromoszóma: 227 362 038–227 379 306 (GRCh38)
Exonok
4 exon, összesen 17,3 kb
Fehérje
229 aminosav
Más néven ismert
FLJ22800, TCCE518
MANE Select transzkriptum
ENST00000304568.4NM_024795.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) TM4SF20 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A TM4SF20 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
2. kromoszóma, a TM4SF20 helyét zárójel jelöli. A TM4SF20 és környékén 16 gén a 2. kromoszómán, 226 870 672–227 870 671 között.2. kromoszóma2q36.3p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.3227 Mb227,2 Mb227,4 Mb227,6 Mb227,8 MbRHBDD1: 226 835 581–227 001 006, előre szálRHBDD1COL4A4: 227 002 713–227 164 559, fordított szálCOL4A4COL4A3: 227 164 509–227 314 792, előre szálCOL4A3MFF: 227 325 151–227 361 188, előre szálMFFTM4SF20: 227 362 038–227 379 306, fordított szálTM4SF20SCYGR1: 227 387 683–227 387 949, fordított szálSCYGR1AGFG1: 227 472 134–227 561 411, előre szálAGFG1SCYGR2: 227 598 893–227 599 255, előre szálSCYGR2SCYGR10: 227 608 784–227 609 101, előre szálSCYGR10SCYGR3: 227 614 538–227 614 840, fordított szálSCYGR3SCYGR4: 227 617 498–227 617 815, előre szálSCYGR4SCYGR5: 227 666 804–227 667 061, előre szálSCYGR5SLC19A3: 227 683 763–227 718 088, fordított szálSLC19A3SCYGR6: 227 724 440–227 724 757, fordított szálSCYGR6SCYGR7: 227 728 335–227 728 625, előre szálSCYGR7SCYGR8: 227 745 894–227 746 220, előre szálSCYGR8CCL20: 227 805 739–227 817 564, előre szálCCL20A TM4SF20 ábrája: 4 exon a(z) 2. kromoszóma fordított szálán4. exon: 227 362 038–227 364 012, 1975 bázis3. exon: 227 366 093–227 366 244, 152 bázis2. exon: 227 370 915–227 370 980, 66 bázis1. exon: 227 379 086–227 379 306, 221 bázis43215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 17,3 kb-jából 2,4 kb-ot tesznek ki; ezek közül 690 bázis kódolja a fehérjét.

TM4SF20 szekvenálása

0Alacsony

Mennyire nehéz a TM4SF20 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Ismétlődések2,5%
  • GC-tartalom0%
  • Referencia-lefedettség0%

1

a TM4SF20 génben olyan pozíció, ahol a ClinVar a változást patogénnek vagy valószínűleg patogénnek minősíti

Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen találnak meg.

A teljes genom a TM4SF20 gén mind a 17,3 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csupán az 2,4 kb-nyi exont.

A(z) TM4SF20 génhez kapcsolódó tulajdonságok

Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) TM4SF20 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
  • Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
  • Adatkiadás: 2026.10.17-8666dff2.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). TM4SF20 gén: transmembrane 4 L six family member 20. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/tm4sf20

Vancouver

Dante Labs. TM4SF20 gén: transmembrane 4 L six family member 20 [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/tm4sf20

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet