Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

SMIM41

small integral membrane protein 41

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
12q13.13
Koordináták
12. kromoszóma: 52 079 704–52 108 255 (GRCh38)
Exonok
3 exon, összesen 28,6 kb
Fehérje
93 aminosav
MANE Select transzkriptum
ENST00000546390.2NM_001369216.1
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) SMIM41 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A SMIM41 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
12. kromoszóma, a SMIM41 helyét zárójel jelöli. A SMIM41 és környékén 25 gén a 12. kromoszómán, 51 593 980–52 593 979 között.12. kromoszóma12q13.13p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3351,6 Mb51,8 Mb52 Mb52,2 Mb52,4 MbSCN8A: 51 590 266–51 812 864, előre szálSCN8ATMDD1: 51 813 921–51 814 925, fordított szálTMDD1FIGNL2: 51 817 899–51 848 729, fordított szálFIGNL2ANKRD33: 51 888 009–51 891 727, előre szálANKRD33ACVRL1: 51 906 908–51 923 361, előre szálACVRL1ACVR1B: 51 951 675–51 997 082, előre szálACVR1BTAMALIN: 52 006 941–52 015 893, előre szálTAMALINNR4A1: 52 022 832–52 059 509, előre szálNR4A1ATG101: 52 069 246–52 077 495, előre szálATG101SMIM41: 52 079 704–52 108 255, előre szálSMIM41KRT80: 52 168 996–52 192 311, fordított szálKRT80KRT7: 52 232 520–52 252 186, előre szálKRT7KRT86: 52 249 300–52 309 163, előre szálKRT86KRT81: 52 285 913–52 291 534, fordított szálKRT81KRT83: 52 314 301–52 321 398, fordított szálKRT83KRT85: 52 360 006–52 367 481, fordított szálKRT85KRT84: 52 377 812–52 385 652, fordított szálKRT84KRT82: 52 393 931–52 406 335, fordított szálKRT82KRT75: 52 424 070–52 434 380, fordított szálKRT75KRT6B: 52 446 651–52 452 154, fordított szálKRT6BKRT6C: 52 468 516–52 473 805, fordított szálKRT6CKRT6A: 52 487 176–52 493 265, fordított szálKRT6AKRT5: 52 514 575–52 520 530, fordított szálKRT5KRT71: 52 543 909–52 553 145, fordított szálKRT71KRT74: 52 565 151–52 573 843, fordított szálKRT74KRT72: 52 585 589–52 601 538, fordított szálKRT72A SMIM41 ábrája: 3 exon a(z) 12. kromoszóma előre szálán1. exon: 52 079 704–52 080 181, 478 bázis2. exon: 52 083 894–52 083 968, 75 bázis3. exon: 52 107 379–52 108 255, 877 bázis1235′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 28,6 kb-jából 1,4 kb-ot tesznek ki; ezek közül 282 bázis kódolja a fehérjét.

SMIM41 szekvenálása

56Nehéz

Mennyire nehéz a SMIM41 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A SMIM41 nagy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok elronthatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ehhez hozzájárul: a SMIM41 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség22%
  • Homológia61%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések14%
  • GC-tartalom33%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). SMIM41 gén: small integral membrane protein 41. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/smim41

Vancouver

Dante Labs. SMIM41 gén: small integral membrane protein 41 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/smim41

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet