Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

SLC22A31

solute carrier family 22 member 31

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
16q24.3
Koordináták
16. kromoszóma: 89 195 761–89 200 537 (GRCh38)
Exonok
9 exon, összesen 4,8 kb
Fehérje
446 aminosav
MANE Select transzkriptum
ENST00000682282.1NM_001384763.1
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) SLC22A31 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A SLC22A31 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
16. kromoszóma, a SLC22A31 helyét zárójel jelöli. A SLC22A31 és környékén 22 gén a 16. kromoszómán, 88 698 149–89 698 148 között.16. kromoszóma16q24.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.388,8 Mb89 Mb89,2 Mb89,4 Mb89,6 MbRNF166: 88 696 494–88 706 424, fordított szálRNF166CTU2: 88 706 470–88 717 853, előre szálCTU2PIEZO1: 88 715 338–88 785 251, fordított szálPIEZO1CDT1: 88 803 777–88 809 258, előre szálCDT1APRT: 88 808 323–88 811 970, fordított szálAPRTGALNS: 88 813 733–88 857 832, fordított szálGALNSTRAPPC2L: 88 856 220–88 862 686, előre szálTRAPPC2LPABPN1L: 88 863 333–88 866 660, fordított szálPABPN1LCBFA2T3: 88 874 858–88 977 207, fordított szálCBFA2T3ACSF3: 89 088 375–89 164 121, előre szálACSF3CDH15: 89 171 742–89 195 492, előre szálCDH15SLC22A31: 89 195 761–89 200 537, fordított szálSLC22A31ZNF778: 89 217 683–89 237 141, előre szálZNF778ANKRD11: 89 267 619–89 490 706, fordított szálANKRD11: 89 317 046–89 418 292, fordított szálSPG7: 89 490 719–89 557 768, előre szálSPG7RPL13: 89 560 637–89 567 834, előre szálRPL13CPNE7: 89 575 730–89 597 247, előre szálCPNE7DPEP1: 89 613 308–89 638 456, előre szálDPEP1CHMP1A: 89 640 816–89 657 738, fordított szálCHMP1ASPATA33: 89 657 740–89 671 287, előre szálSPATA33CDK10: 89 680 737–89 696 372, előre szálCDK10SPATA2L: 89 696 357–89 701 733, fordított szálSPATA2LA SLC22A31 ábrája: 9 exon a(z) 16. kromoszóma fordított szálán9. exon: 89 195 761–89 196 305, 545 bázis8. exon: 89 197 298–89 197 409, 112 bázis7. exon: 89 198 122–89 198 336, 215 bázis6. exon: 89 198 442–89 198 550, 109 bázis5. exon: 89 198 652–89 198 797, 146 bázis4. exon: 89 199 023–89 199 191, 169 bázis3. exon: 89 199 413–89 199 567, 155 bázis2. exon: 89 199 713–89 199 816, 104 bázis1. exon: 89 200 478–89 200 537, 60 bázis9876543215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 4,8 kb-jából 1,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1341 bázis kódolja a fehérjét.

SLC22A31 szekvenálása

22Közepes

Mennyire nehéz a SLC22A31 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A SLC22A31 exonjainak egy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok elronthatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ehhez hozzájárul: a SLC22A31 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség3,2%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések4,4%
  • GC-tartalom93%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). SLC22A31 gén: solute carrier family 22 member 31. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/slc22a31

Vancouver

Dante Labs. SLC22A31 gén: solute carrier family 22 member 31 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/slc22a31

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet