Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

LOXL1

lysyl oxidase like 1

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
15q24.1
Koordináták
15. kromoszóma: 73 926 462–73 952 136 (GRCh38)
Exonok
7 exon, összesen 25,7 kb
Fehérje
574 aminosav
Más néven ismert
LOXL, LOL
MANE Select transzkriptum
ENST00000261921.8NM_005576.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) LOXL1 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A LOXL1 felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
15. kromoszóma, a LOXL1 helyét zárójel jelöli. A LOXL1 és környékén 14 gén a 15. kromoszómán, 73 439 299–74 439 298 között.15. kromoszóma15q24.1p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q14q15.1q15.2q15.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26.1q26.2q26.373,6 Mb73,8 Mb74 Mb74,2 Mb74,4 MbREC114: 73 443 147–73 560 020, előre szálREC114NPTN: 73 546 512–73 634 134, fordított szálNPTNCD276: 73 683 966–73 714 519, előre szálCD276INSYN1: 73 735 440–73 753 357, fordított szálINSYN1TBC1D21: 73 873 564–73 889 214, előre szálTBC1D21LOXL1: 73 926 462–73 952 136, előre szálLOXL1STOML1: 73 978 926–73 994 622, fordított szálSTOML1PML: 73 994 673–74 047 827, előre szálPMLGOLGA6A: 74 069 857–74 082 550, fordított szálGOLGA6AISLR2: 74 100 311–74 138 540, előre szálISLR2ISLR: 74 172 414–74 176 872, előre szálISLRSTRA6: 74 179 466–74 212 267, fordított szálSTRA6CCDC33: 74 202 705–74 336 472, előre szálCCDC33CYP11A1: 74 337 746–74 367 884, fordított szálCYP11A1SEMA7A: 74 409 289–74 433 965, fordított szálSEMA7AA LOXL1 ábrája: 7 exon a(z) 15. kromoszóma előre szálán1. exon: 73 926 462–73 927 885, 1424 bázis2. exon: 73 942 854–73 942 962, 109 bázis3. exon: 73 946 417–73 946 554, 138 bázis4. exon: 73 947 067–73 947 223, 157 bázis5. exon: 73 947 807–73 947 902, 96 bázis6. exon: 73 949 459–73 949 574, 116 bázis7. exon: 73 951 831–73 952 136, 306 bázis12345675′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 25,7 kb-jából 2,3 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1725 bázis kódolja a fehérjét.

LOXL1 szekvenálása

16Közepes

Mennyire nehéz a LOXL1 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A LOXL1 exonjainak egy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok elronthatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.

Ehhez hozzájárul: a LOXL1 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések8,4%
  • GC-tartalom67%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

A(z) LOXL1 génhez kapcsolódó tulajdonságok

Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) LOXL1 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
  • Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). LOXL1 gén: lysyl oxidase like 1. Lekérve: 2026. október 21., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/loxl1

Vancouver

Dante Labs. LOXL1 gén: lysyl oxidase like 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 21.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/loxl1

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet