Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA
Sekvenser genomet ditt (åpnes i en ny fane)

Gen

LOXL1

lysyl oxidase like 1

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
15q24.1
Koordinater
Kromosom 15: 73 926 462–73 952 136 (GRCh38)
Eksoner
7 eksoner over 25,7 kb
Protein
574 aminosyrer
Også kjent som
LOXL, LOL
MANE Select-transkripsjon
ENST00000261921.8NM_005576.4
Lokustype
Proteinkodende
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser LOXL1 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er LOXL1 bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom 15, med en parentes der LOXL1 står. LOXL1 og 14 gener i nærheten på kromosom 15, fra 73 439 299 til 74 439 298.Kromosom 1515q24.1p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q14q15.1q15.2q15.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26.1q26.2q26.373,6 Mb73,8 Mb74 Mb74,2 Mb74,4 MbREC114: 73 443 147–73 560 020, fremover-strengREC114NPTN: 73 546 512–73 634 134, bakover-strengNPTNCD276: 73 683 966–73 714 519, fremover-strengCD276INSYN1: 73 735 440–73 753 357, bakover-strengINSYN1TBC1D21: 73 873 564–73 889 214, fremover-strengTBC1D21LOXL1: 73 926 462–73 952 136, fremover-strengLOXL1STOML1: 73 978 926–73 994 622, bakover-strengSTOML1PML: 73 994 673–74 047 827, fremover-strengPMLGOLGA6A: 74 069 857–74 082 550, bakover-strengGOLGA6AISLR2: 74 100 311–74 138 540, fremover-strengISLR2ISLR: 74 172 414–74 176 872, fremover-strengISLRSTRA6: 74 179 466–74 212 267, bakover-strengSTRA6CCDC33: 74 202 705–74 336 472, fremover-strengCCDC33CYP11A1: 74 337 746–74 367 884, bakover-strengCYP11A1SEMA7A: 74 409 289–74 433 965, bakover-strengSEMA7ADiagram av LOXL1: 7 eksoner på fremover-strengen til kromosom 15Ekson 1: 73 926 462–73 927 885, 1 424 baserEkson 2: 73 942 854–73 942 962, 109 baserEkson 3: 73 946 417–73 946 554, 138 baserEkson 4: 73 947 067–73 947 223, 157 baserEkson 5: 73 947 807–73 947 902, 96 baserEkson 6: 73 949 459–73 949 574, 116 baserEkson 7: 73 951 831–73 952 136, 306 baser12345675′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 2,3 kb av genets 25,7 kb, og 1 725 av disse basene koder for proteinet.

Sekvensering av LOXL1

16Moderat

Hvor vanskelig LOXL1 er å sekvensere med korte leser, av 100

Noen av eksonene til LOXL1 ligger der korte leser kan overse eller feilplassere en endring.

Det som bidrar: andelen av eksonene til LOXL1 i hver type vanskelig område

  • Kartleggbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Shared with chrY0 %
  • Referansedekning0 %
  • Repetisjoner8,4 %
  • GC-innhold67 %

En Dante Labs-score basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummen

Egenskaper knyttet til LOXL1

The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene LOXL1 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.

Eksterne lenker

Her kommer dette fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
  • Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
  • The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). LOXL1-genet: lysyl oxidase like 1. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/loxl1

Vancouver

Dante Labs. LOXL1-genet: lysyl oxidase like 1 [Internett]. [sitert 19. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/loxl1

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test